学部主席团是院士大会闭会期间的常设领导机构。由
中国科学院院长、1位分管学部工作的院士副院长、5个学部主任和由院士大会选举产生的12名院士组成。由院长、1位院士副院长和5个学部主任组成执行委员会，院长为主席团执行主席。执行委员会设秘书长1人，受执行委员会委托，负责学部的日常工作。学部主席团聘请
中国工程院院长、
中国社会科学院院长、
中国科学技术协会主席、
国家自然科学基金委员会主任和若干政府部门的负责人为顾问。
职能
学部主席团的职能为：
（一）决定召开并主持院士大会。
（二）审议并决定提交院士大会的各项议案。
（三）聘请主席团顾问。
（四）批准各学部常务委员会和各专门委员会组成人员名单。
（五）聘任执行委员会秘书长。
（六）决定各学部增选院士名额。
（七）审议各学部增选院士的选举结果。
（八）确定外籍院士正式候选人名单。
（九）审查和批准撤销院士称号的决定。
（十）根据需要，决定设立跨学部的专门委员会。
（十一）院士大会授予的其他职能。
主席团下设咨询评议工作委员会，负责组织、领导学部咨询、评议工作。咨委会由主席团2名成员、各学部1名院士和中国工程院咨委会1名副主任（院士）组成，主席团2名成员和中国工程院咨委会副主任任正、副主任。
主席团下设科学道德建设委员会，负责学部科学道德和学风建设工作。道德委员会由主席团两名成员和各学部一名院士组成，主席团两名成员任正、副主任。
中国科学院学部现设数学物理学部、化学部、生物学部、地学部、技术科学部等五个学部。院士按其所从事研究的学科领域，分别参加一个学部。各学部分别从本学部的院士中，选举产生15名至23名常务委员，组成学部常务委员会，负责本学部的工作。学部常务委员会推选学部主任1人、副主任3人至5人，主持学部工作和学部全体院士会议。
第一届
（1981－1992）
执行主席：
1981.5－1992.4
严济慈 李 昌*(至1984.1) 吴仲华
1984.1－1992.4
卢嘉锡 武 衡 钱学森
成员（以姓氏笔画为序）：
于光远 王大珩 王淦昌 叶笃正 冯德培 卢嘉锡
华罗庚 宋 平* 严东生 严济慈 李 昌* (至1984.1)
李 薰 吴仲华 吴征镒 武 衡 郁 文* 周培源
张文佑 张光斗 胡克实* 侯祥麟 秦力生* 钱三强
钱学森 涂光炽 高 沂* 唐敖庆 黄家驷 谢希德（女）
*为非学部委员成员
第二届
（1992－1996）
名誉主席：严济慈 吴仲华 卢嘉锡 武 衡 钱学森
执行主席：周光召
成员（以姓氏笔画为序）：
王 绶 王德宝 师昌绪 孙鸿烈 吴文俊 吴阶平
严东生 邹承鲁 张存浩 张炳熹 宋 健 李振声
闵恩泽 林兰英（女） 周光召 涂光炽 高景德
钱令希 黄 昆 黄维垣 谢希德（女）
执行委员会（以姓氏笔画为序）：
王 绶 师昌绪 李振声 吴文俊 严东生 邹承鲁
张存浩 周光召 涂光炽
第三届
（1996－2000）
学部主席团
名誉主席：严济慈 卢嘉锡 武 衡 钱学森
执行主席：周光召(至1997.10) 路甬祥(1997.10起)
成 员（以姓氏笔画为序）:
王 元 王 越 王佛松(1998.6起)
方守贤(至1998.6) 冯 端 师昌绪 李德生
张存浩(至1998.6) 邹承鲁(至1998.6) 沈善炯
陈宜瑜(至1999.12) 陈能宽
周光召(至1997.10) 郑哲敏(至1998.6)
赵忠贤(1998.6起) 娄成后 徐冠华 倪嘉缵
涂光炽 梁晓天 梁栋材(1998.6起) 路甬祥
许智宏(1999.12起)
执行委员会
（以姓氏笔画为序）
王 越(1998.6起) 王佛松(1998.6起)
方守贤(至1998.6) 许智宏(1999.12起)
邹承鲁(至1998.6) 张存浩(至1998.6)
陈宜瑜(至1999.12) 周光召(至1997.10)
郑哲敏(至1998.6) 赵忠贤(1998.6起)
徐冠华 梁栋材(1998.6起) 路甬祥(1997.10起)
顾问
王统业(至1998.6) 王万宾(2000.3起)
韦 钰(女) 李铁映(1998.6起)
朱光亚(至1998.6) 朱丽兰(女)
怀国模(至1998.6) 刘积斌 陈达植(1998.6起)
陈佳洱(1999.12起) 宋 健(1998.6起)
胡 绳(至1998.6) 张志刚(1998.6至2000.3)
张存浩(至1999.12) 张玉台
周光召(1997.10起) 楼继伟(1998.6起)
委员会秘书长
郭传杰(至1997.10) 钱文藻 (1997.10起)
第四届
（2000－2004）
学部主席团
名誉主席：钱学森
执行主席：路甬祥
成员（以姓氏笔画为序）：
王 夔 王大中(至2002.6) 王佛松 艾国祥（2002.6起）
母国光 孙 枢 孙鸿烈 许智宏 吴 旻 吴德馨(女)
张存浩 李依依(女) 李振声 杨 乐 陈佳洱(至2002.6)
陈宜瑜（2002.6起） 周炳琨（2002.6起） 赵忠贤
徐冠华 顾诵芬 梁栋材(至2002.6) 路甬祥
执行委员会
（以姓氏笔画为序）
路甬祥 许智宏 陈佳洱(至2002.6)
艾国祥（2002.6起）王佛松 梁栋材(至2002.6)
陈宜瑜（2002.6起）孙 枢 王大中(至2002.6)
周炳琨（2002.6起）
执委会秘书长：
钱文藻（至2002.3） 沈保根（2002.3起）
顾问
王万宾(2000.3起) 王春正 韦 钰(女)(至2001.5)
刘积斌 朱丽兰(女) 宋 健 李铁映 张玉台
张志刚(至2000.3) 陈达植 陈佳洱 周光召
赵沁平(2001.5起) 楼继伟
第五届
（2004-2008）
学部主席团
执行主席：路甬祥
成 员：方守贤 王佛松 白春礼 刘永坦 孙 枢(至2006.6)
秦大河(2006.6起) 朱 静 朱作言(2006.6起)
许智宏 李廷栋 李静海 陈可冀 陈宜瑜 周光召
周炳琨(至2006.6) 李衍达(2006.6起) 贺贤土(至2006.6)
杨国桢(2006.6起) 赵忠贤 徐建中(至2006.6) 程津培
程耿东 梁栋材 路甬祥 戴汝为 欧阳自远
执行委员会
执行主席：路甬祥
成 员：白春礼 孙 枢(至2006.6) 许智宏 李静海 陈宜瑜
周炳琨(至2006.6) 贺贤土(至2006.6) 赵忠贤
徐建中(至2006.6) 路甬祥 杨国桢(2006.6起) 秦大河(2006.6起)
李衍达(2006.6起) 朱 静(2006.6起) 朱作言(2006.6起)
秘 书 长：沈保根
顾问
徐匡迪 中国工程院院长
陈奎元 中国社会科学院院长
徐冠华 科学技术部部长
周光召 中国科学技术协会主席
王春正 国家发展计划委员会副主任
张华祝 国防科学技术工业委员会副主任
赵沁平 教育部副部长
楼继伟 财政部常务副部长
李安东 中国人民解放军总装备部副部长
陈宜瑜 国家自然科学基金委员会主任
张玉台 国务院发展研究中心
第六届
学部主席团
名誉主席：周光召 路甬祥（2011年3月25日起）
执行主席：路甬祥（至2011年3月25日）
白春礼（2011年3月25日起）
成 员（按姓氏笔画排列）：
王志珍（女） 叶恒强 白以龙 刘盛纲 孙 枢
朱作言 朱道本 佟振合 张礼和 李衍达 李家洋
李静海 杨 卫 杨国桢 沈文庆 陈宜瑜 周兴铭
林其谁 徐冠华 秦大河 顾秉林
执行委员会
执行主席：路甬祥（至2011年3月25日）
白春礼（2011年3月25日起）
成 员（按姓氏笔画排列）：
朱作言 朱道本 李衍达 李静海 杨 卫
沈文庆 陈宜瑜 林其谁 秦大河
秘 书 长：王恩哥（至2010年1月29日）
曹效业（2010年1月29日起）
顾问
徐匡迪 中国工程院院长
陈奎元 中国社会科学院院长
韩启德 中国科学技术协会主席
陈宜瑜 国家自然科学基金委员会主任
朱之鑫 国家发展和改革委员会副主任、党组副书记
赵沁平 教育部副部长
万 钢 科学技术部部长
陈求发 工业和信息化部副部长
廖晓军 财政部副部长、党组副书记
谢伏瞻 国务院研究室主任
张玉台 国务院发展研究中心主任、党组书记
李安东 中国人民解放军总装备部副部长
第七届
学部主席团
名誉主席：周光召 路甬祥
执行主席：白春礼
成 员（以姓氏笔画为序）：
丁仲礼 马志明 王占国 叶培建 白春礼 朱作言
朱道本 许智宏 何鸣元 李 未 李衍达 李静海
杨 卫 沈文庆 陈运泰 陈宜瑜 陈 颙 周其凤
林其谁 赵忠贤 秦大河 顾秉林 程津培 詹文龙
执行委员会
执行主席：白春礼
成 员（以姓氏笔画为序）：
白春礼 朱道本 许智宏 李 未 李静海 沈文庆
陈宜瑜 陈 颙 周其凤 秦大河 顾秉林 詹文龙
秘 书 长：曹效业
第八届
学部主席团
名誉主席：周光召 路甬祥 白春礼
执行主席：侯建国
成员（以姓氏笔画为序）：
丁仲礼（自2018年4月至2020年5月） 王恩哥 朱道本
刘国治 安芷生 许智宏 李树深 李静海（至2017年1月止）
杨 卫 杨玉良 沈文庆 张 涛（自2017年1月至2018年1月）
陈宜瑜 陈 颙 欧阳钟灿 周其凤 胡海岩 饶子和
秦大河 顾秉林 高鸿钧（自2020年9月起） 傅伯杰
詹文龙 褚君浩 裴 钢
执行委员会
执行主席：侯建国
成员（以姓氏笔画为序）：
丁仲礼（自2018年4月至2020年5月） 王恩哥 朱道本
李树深 李静海（至2017年1月止） 杨 卫
杨玉良 张 涛（自2017年1月至2018年1月）
沈文庆 陈宜瑜 秦大河 高鸿钧（自2020年9月起）
傅伯杰 裴 钢
秘书长： 曹效业（至2017年3月止）
汪克强（自2017年3月至2020年5月）
高鸿钧（自2020年6月起）
第九届
学部主席团
名誉主席：周光召 路甬祥 白春礼
执行主席：侯建国
成员（以姓氏笔画为序）：
王恩哥 申长雨 包为民 包信和 朱日祥
李家洋 李静海 杨 卫 杨玉良 怀进鹏
张 希 张 涛 周忠和 胡海岩 饶子和
贺福初 袁亚湘 高鸿钧 郭 雷 傅伯杰
裴 钢 薛其坤
执行委员会
执行主席：侯建国
成员（以姓氏笔画为序）：
包信和 朱日祥 杨 卫 杨玉良 张 涛
胡海岩 饶子和 高鸿钧 郭 雷 裴 钢
秘书长：高鸿钧
最新倡议
中国科学院学部主席团2013年4月28日发布《关于负责任的转基因技术研发行为的倡议》，号召广大科研人员加强职业操守，规范科研行为，促进转基因技术良性发展。
倡议说，转基因技术是现代科学和技术迅速发展的必然结果，在医药、工业、农业、环保、能源、新材料等领域有着广泛的应用前景，必将为人类社会提供新的发展空间。但转基因技术和其他高技术一样，如有不规范的研发和滥用也可能带来安全风险。为此倡议从事转基因基础研究、应用研究和产品开发，以及在相关机构中负责转基因技术安全监测和评价、检测技术研究的科研人员，以对人类社会发展高度负责任的态度，加强职业操守，规范科研行为，履行社会责任，积极与社会沟通，促进转基因技术良性发展。
倡议指出，从事转基因技术研究与开发应自觉遵守国家有关转基因生物安全管理的法律法规、技术规程和管理体系，遵循国际相关生物安全公约。在增进转基因科学知识，推进转基因技术发展的同时，积极关注技术应用的社会和环境效果，预见技术的潜在风险，自觉规避技术的负面影响。
科学家在转基因技术的决策咨询、风险管理、科技传播中承担着重要的角色，应尊重公众知情权，以恰当的方式就转基因安全风险问题与公众沟通。同时倡议科研人员秉持科研诚信、积极督促同行、接受社会监督等。