中国科学院沙漠研究所，一个存在于1978～1999年间的科研单位，是现中国科学院寒区旱区环境与工程研究所的前身之一。

原中国科学院兰州沙漠研究所建立于1978年5月，其前身是1959年成立的中国科学院治沙队。

原中国科学院兰州沙漠研究所以沙漠和沙漠化为研究对象，以风沙灾害防治和干旱、半干旱区生态环境改善及国土整治为研究内容，属应用基础和应用技术为主的研究机构。下设沙漠化及风沙、沙区农业自然资源、干旱区生态及流沙固定、自然条件综合研究、沙漠化监测及遥感、物质成分综合分析、仪研制、出版文献情报等研究室与技术室，并在我国不同类型沙漠化地区建立了多个试验站。其中宁夏中卫沙坡头科学试验站，经中国科学院批准对国内外开放，现已成为联合国环境署和世界实验室的科研项目点之一，也是国际沙漠化治理研究培训中心和我国沙区重大建设项目试验培训基地。

1.研究沙漠化的发生发展过程、演变趋势的预测及其逆转的整治途径，特别是在不同自然条件下分析沙漠及沙漠化典型地区的成因、生态变化、危险性评估、发展趋势监测、逆转过程和整治模式可行性研究，为国土整治提供对策;

2.研究国民经济发展中的重大项目可能引起的沙漠化的预测与防治;

3.开展我国沙区农业自然资源的合理开发和开发后所引起环境的变化及治理途径的研究;

4.开展防治风沙灾害体系的风沙物理学及生态学原理的研究。“八五”期间继续承担全国沙漠化动态监测和宏观战略研究;沙漠化(风沙化)区域综合整治研究;沙区重大建设项目沙害防治研究及基础理论方面的研究。

原中国科学院兰州沙漠研究所编辑出版了《中国沙漠》、《世界沙漠研究》和《中国科学院兰州沙漠研究所集刊》3种刊物。

据1992年资料， 原中国科学院兰州沙漠研究所自1987年以来共取得70项科研成果，其中获国家级奖2项，省部级奖17项。《包兰线沙坡头地段铁路治沙防护林体系的建立》成果与铁路、林业部门共获国家科技进步特等奖。

1985年5月联合国环境规划署授予当时的中国科学院兰州沙漠研究所“全球环境先进单位”称号。