两界系统是传统的
生物分界系统，即把生物分为动物世界与植物世界。十八世纪瑞典自然科学家林奈是这种分界的奠基人。
根据这种分类方法，凡有绿色叶片，可以进行光合作用，制造有机物，根生于土中，不能自由运动，并能无限生长的就是植物。所以，真菌当时就归入了植物界。与此相反，能自由运动，不营光合作用，以植物或其它有机物为营养物质，并有限生长的，都属动物界。
1972年，爱尔曼和狄德摩（P．L．Altman and D．S．Dittmer）仍然主张按林奈的传统分类法把生物分为两界，植物界包括细菌、蓝藻、绿藻、金藻、褐藻、红藻、粘菌、真菌、苔藓和维管束植物。动物界包括原生动物和多细胞动物。