三沙中心小学创办于清
光绪三十二年（公元一九〇六年四月）,是一所历史悠久、规模较大、办学显著的百年老校。前身为县立第二区第一小学堂，是闽东最早兴办的小学之一，先后易名为三沙高等小学、沙澳小学、三沙镇国民小学，解放后命名为三沙中心小学，文革时期定名为三沙东澳小学，1978年恢复三沙中心小学。
1995年被确认为
福建省农村示范小学。建校近百年来，不仅人才辈出，而且富有光荣的
革命传统。原国务院秘书长杜星垣，著名考古专家、全国茶文化界的领军人物”之一,中国农业考古第一人
陈文华教授，中国第一位留欧航空法学博士
吴建端等都在这里受过启蒙教育。特别值得一提的是，在革命战争年代，许多校友为新中国的解放事业，献出了年轻的生命。如投身于霞浦地下党组织，传播革命真理的刘宜坤、张世尊、温汉成、杜星辉、蔡世寇等都曾在这里就读。
学校位于风光秀丽的对台开放窗口——三沙渔港，现(2008年9月)有24个教学班，学生1300多人，教师61人。校园占地面积10亩，校舍建筑面积4689平方米，拥有多媒体阶梯教室、电脑网络教室、电子备课室、市级达标自然实验室、语音室、美术室、音乐室、排练厅、演播室、劳技室、多功能活动厅、省级达标图书室。等各类专用室10多间。校园具备水、电、广播、
程控电话、
闭路电视、电脑网络（局部联网）六大系统设施，初步实现了教学和管理手段的现代化。
学校全面贯彻党的教育方针，广泛开展素质教育，整体构建学校德育工作体系，立足校史乡情，挖掘教育资源，建立育人基地，形成学校、家庭、社会三结合的教育网络。学校注重创新精神和实践能力的培养，开展“合格+特长”的学生培养计划以及争创“规范+特色”学校的活动，力争做到“育优生、培名师、创名校”。
“百年岁月变迁，百年历史积淀，形成了三沙中心校优良的办学传统和浓厚的文化底蕴。艺术美育、智慧课堂是我们的办学特色。”创建“文明学校”和“省农村示范小学”活动为主的全面实施素质教育；以
爱国主义系列化教育、“在家做好孩子，在校做好学生”的“双好”活动和“家校共学，军校共建，社区共育”活动为主旋律的德育工作；以武术体育传统项目为协奏曲的活动构成学校鲜明而突出的三大办学特色。学校确定了“办学有特色、教学有特点、学生有特长”的办学宗旨，制定了“三沙中心小学素质教育发展目标”，对学生的思想道德、科学文化、个性心理、劳动技能、体质体能、审美塑美、特殊才能七个方面提出了具体的素质要求，进一步明确了全面发展目标。
教师们注意应用现代教育技术手段，面向全体学生，注意创设愉快和谐的教学氛围，热情帮助学生“树立爱学志向，培养乐学情趣，提高会学能力”，激励引导学生学会“做学习的主人，做生活的主人，做集体的主人”，激发学生满怀信心地进取，主动生动地发展，愉快健康地成长。学校坚持素质教育发展目标，把握特色，落实课改，不断提高整体办学水平和师生整体素质，取得了可喜的成绩和办学效益。
学校拥有一支高素质的教师队伍，获
大专文凭的占教师数90%，小学高级教师以上职称38人占52%，省地级优秀青年教师有4人，省级普通话测试员2人。有20多位教师获省级以上各类表彰，100多篇教学论文、经验文章在省级以上刊物发表获奖。“爱岗敬业、追求卓越”的学校精神蔚然成风，教科研氛围浓厚，成果突出。学生有100多人次参加全国、省、地各项竞赛获奖；学校被定为全国小学作文改革实验学校、小公民道德建设实验学校；先后荣获全国少先队红旗大队、省文明学校、省农村示范校，全国小公民道德建设先进集体。