PCR标记法是在PCR反应底物中，将一种dNTP换成标记物标记成dNTP的一种方法， 这样标记的dNTP就在PCR反应的同时掺入到新合成的DNA链上。这个过程通常以实验图的形式展示出来。

从固体平板挑取转化带有目的基因的单菌落，用特异引物通过聚合酶链式反应可直接扩增和标记目的基因，不需经过菌的液体培养、质粒提取和酶解反应等复杂过程，能快速获得目的基因扩增产物和进行目的基因探针的标记。

探针是核酸分子杂交及分子标记研究进行的必要前提，在Southern blot、Northern blot、ALFP、 RFLP、RAPD、SSR等技术中得到了广泛应用，在分子生物学的研究中充分发挥着作用，尤其对核酸分子操作具有十分重要的意义。因此，探针的制备与标记已成为核酸研究中最常规和普遍的技术，但目前的探针标记方法主要是将质粒或λDNA 经限制性内切酶酶解后分离目的片段，再用切口平移标记法或随机引物标记法进行标记，耗时很长且效率低，而用PCR聚合酶链式反应只须极少量的DNA模板（50～100ng），即可扩增出大量高效标记的目的片段，但仍需进行质粒的提取工作，最少也要2～3d才能完成全过程。为了进一步提高探针标记的效率，本试验进行PCR方法直接从菌中标记目的基因的研究，仅需2～3h即可获得高效率标记的探针，也可直接从具目的基因载体质粒中扩增出目的基因，同时适用于不需提取质粒DNA迅速鉴定细菌转化的转化子。 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------