龙虎殿高踞于世界自然遗产、国家重点风景名胜区、江西上饶三清山天门峰东侧海拔1568米的龙首山上。为文王后天八卦“震”位布局建置。建于明朝天顺丁丑（1457）年。 因殿前左右两侧利用天然山岩浮雕有青龙、白虎造像，造型生动逼真，故名龙虎殿。

三清山龙虎殿以20条小方石柱圈成一座无顶殿，仿木斗拱结构缩形构建干砌成鳌顶式。前庭后殿，左右廊庑配殿封闭式庭院结构，殿宽6.63米，进深7.2米，脊高4.2米，面积49.7平方米。正殿门为石构牌坊式殿门，宽约1米，高1.90米。进门后为露天庭院，宽4.3米，进深2.7米。庭院左右两边为廊庑配殿，左右各设7阁小神龛。前三个神龛略大，宽0.9米，高0.8米；后4个神龛略小，宽0.55米，高0.60米。整个建筑未用一滴砂浆，朴质而富有野趣。今已改建，不及从前规模。

庭院之内正中大殿设石台阶五级，五级台阶之上以4根方0.27米×0.27米，高1.80米石柱支撑殿顶形成三间宽0.70米的龛阁，内供老子等三尊神像。两边神龛原供石雕神像各9尊，全殿共21尊，现所存无几，且大部分残缺无头。

殿前石崖竖壁上阴刻有“龙首山”三字。

南京自古号称“龙蟠虎踞”之地，朱元璋打下大明江山后将皇宫建于钟山。今观其规格建置，三清山龙虎殿与其它道教名山龙虎殿之设置风格迥异。虎踞龙蟠，石雕、石刻有象征皇帝坐朝，百官侍服左右，龙虎禁军侍卫门外，居高临下，威仪天下第一的明南京故都金銮宝殿象征。