黑龙江省农业科学院齐齐哈尔分院始建于1958年10月，是黑龙江省发展规模较大、学科设置齐全、科技优势明显、仪器设备先进，以旱地农业综合技术研究为主的公益性科研机构。在职职工99人，其中科技人员58人。科技人员中正高职4人，副高职16人、中级9人。进站博士后1人、硕士10人。在读博士研究生2人、硕士研究生17人。

分院成立50年来，在玉米、大豆、谷糜、食用豆、水稻遗传育种，以及分子标记、基因导入、辐射诱变、太空搭载等辅助育种，作物生理与栽培、蓄水保墒耕作技术、病虫害生物防治技术研究，旱作农业综合技术，小型节水机具及抗旱新方法、新技术研究和赤眼蜂生物防治与产业开发等方面，取得科研成果302项，其中获得国家发明奖2奖、科技进步奖2项，省部级科技进步奖43项，地市级科技进步奖98项。共培育推广农作物品种94个、新技术208项。培养了一支理论扎实、经验丰富、颇有建树的人才队伍，构建起作物育种、农业资源与环境、作物栽培、植物保护、农业科技信息等五大学科、20个研究方向的学科群，并在农作物抗旱育种、旱作节水农业研究、赤眼蜂生物防治等研究领域具有一定优势，为黑龙江省旱区农业发展作出了突出贡献。

分院与荷兰爱沃斯公司、俄罗斯全俄植保所、美国明尼苏达大学、中国农业科学院、东北农业大学、黑龙江八一农垦大学、齐齐哈尔大学建立了科技合作关系。先后出国研修和合作研究5人次、参加国际12人次，国内学术会议39人次，发表论文326篇。

黑龙江省农科院齐齐哈尔分院院将围绕提高科技创新和服务“三农”能力这一目标，大力推广旱作节水农业和植物保护“两大技术”，构建嫩农种业、生防产业和农产品加工“三大产业”、加强玉米、大豆、杂粮和水稻“四大育种”，建设齐齐哈尔区域技术创新中心、农情测报中心建设、县乡农技人员及农民培训中心、成果引进消化吸收利用中心和野生植物资源利用中心“五个中心”，全力推进“12345”兴院工程的实施，建设齐齐哈尔现代农业示范园区，引领黑龙江省现代农业发展。