黑龙江省农业科学院土壤肥料与环境资源研究所始建于1956年，时为土壤肥料系，1960年改为土壤肥料研究所，2008年为适应科研发展的需要更名为土壤肥料与环境资源研究所。

是黑龙江省农业科学院直属在哈专业研究所。我所历经50年风风雨雨，几代人的努力，肩负着为黑龙江省农业发展和生态建设服务的重任。黑龙江省土壤环境与植物营养重点实验室，以土壤、肥料、微生物、植物营养、草业等学科为重点，开展了一系列卓有成效的研究工作。黑土肥力长期定位试验，已被农业部批准为重点野外台站。 土肥所博士后科研工作分站成为高级人才的培养基地。2005年我所在全国农科院系统1700多个研究所综合实力评估中进入百强研究所。

五十年来，土壤肥料与环境资源研究所以全面发展黑龙江省农业生产为中心，承担了各级下达的课题，包括国家科技攻关、国家863计划、有关部委项目、省市项目及各类基金项目，承接了有关部门的合作、协作和委托项目，同时也参加了大量的农村科学技术普及科技服务活动，全所累计完成科研项目322个，获各级成果奖励107项，其中国家级奖励6项，省级科技进步奖15项、省农业科技进步奖及其它奖项86项。这些成果有力地推动了全省农业生产，对全省粮食总产量增加和质量提高起到重要作用。、她正在科研、开发、人才培养、服务三农，建设社会主义新农村中做出重要贡献。

我所的发展目标是：针对东北黑土资源退化问题和农业可持续发展需要，面向全省主要土壤类型和农作物生产，围绕土壤资源与管理、土壤肥力与调控、土壤环境与健康研究领域，开展农作物营养诊断、科学施肥、土壤与水资源利用、草业资源和微生物资源保护与利用以及新型肥料开发与研制的科技创新，为国家粮食安全、土壤生产力的提高和环境质量的改善，提供决策依据和关键实用技术，积极开展国际间合作交流，建成全国一流的研究所。