黑色玉女军，电视剧《神探狄仁杰3》中的组织，是黑衣团的核心力量，由王铣创立，除王铣外包括八名圣骑士，协助她控制黑衣团和甘凉地区。在唐军的作战和黑衣团的内讧中，黑色玉女军受到重创，但其中一位圣骑士幸存，成功组建了黑衣社，沿用黑色玉女军的宗旨和上层架构，图谋再夺甘凉，直至武周年间被狄仁杰粉碎。

北齐建隋中叶，一群西洋武士涌入了甘凉，杀人放火，无恶不作。当时王家堡的奇女子王仙儿组织本村村民杀敌自保。因其作战勇猛，威震甘凉，这支队伍遂被称作黑衣团。随着黑衣团的势力越来越大，王仙儿麾下不仅有附近各地方归附的正规部队，更收留了很多被俘的西洋武士。要管理这支队伍很不容易，而王仙儿又是个行事极端，且仇视男人的怪僻女子，于是，她将自己的名字改为铣，组成了黑衣团的核心力量——黑色玉女军。

黑色玉女军是黑衣团的核心组织，除天王（小说中称“大神”或“黑衣大神”）王铣外，另有八位圣骑士（小说中称“大护法”），而这九人都是未婚女子，她们秘密聚会的地点被称为“黑暗之山”，她们曾经在“黑暗之山”宣誓：“同生死，不相弃；治甘凉，成大业！”自此，王铣和她的八位姐妹踏上了一条不归路。随着权力欲的急剧上升，王铣率黑色玉女军的姐妹们不择手段攫取权力，不但大肆残杀并肩作战的同袍弟兄，还使用歹毒的手段残害治下百姓。

王铣经过多年的大肆掠夺和残酷迫害，终于迫使当时已四面楚歌的前隋皇帝杨广（小说中称“北齐皇帝高虎”）封她为甘凉王。然而好景不长。短短一年工夫，大唐一统天下，太宗敕旨命甘凉归治，王铣拒不从命，与黑色玉女军的姐妹们亲自披挂上阵，抵抗兵锋正锐的唐军。经惨烈战斗，黑衣团主力大部分被消灭，王铣率领不到两千人返回凉州，唐军前锋逼近凉州城下。王铣一面下令将全城百姓逼上城头守城，一面将仅剩的两千余人转入王府地下四通八达的网道之中，准备与唐军进行最后的巷战。而她自己则返回“黑暗之山”与姐妹们商议下一步对策。

这时，黑衣团内一些成员终于不能忍受王铣的残暴、独断与疯狂，他们认为这样的抵抗全然没有意义，是拿全城百姓的生命做赌注。于是，在黑色玉女军议事之时，一位名叫查理的西洋武士（即归义伯王肖恩，王锴的祖父）率人闯进了“黑暗之山”，想要劝说王铣向大唐投诚。然而王铣对此无动于衷，决心一战到底。谈判最终陷入了僵局。查理无奈之下只得动用武力，率部下和王铣等九人血战一场，王铣见取胜无望，最后自杀身亡。

然而，黑色玉女军并没有完全被毁灭。在查理率部逼宫时，有一位圣骑士（大护法）重伤倒地，却没有死；她逃出生天，伤愈之后便四处活动，聚拢那些忠于王铣的失散部下，暗中组成了黑衣社，而她自己便成了黑衣社的第一位黑衣天王（小说中称“黑衣大神”或“尊神”）。

在原剧及小说中，黑色玉女军的情况主要出自狄仁杰的叙述（狄仁杰的信息来源则是查理之孙、归义伯王锴）；黑衣天王“小桃”和乾位圣骑士薇儿曾几度惊讶于狄仁杰了解黑色玉女军的称谓及相关情况，这一方面佐证狄仁杰有关黑色玉女军的叙述基本属实，另一方面也说明黑色玉女军主要是黑衣团时代的历史概念。不过，狄仁杰也提到照黑色玉女军的宗旨要求黑衣天王（黑衣大神）必须由未婚女子担任，由此决定了黑衣天王（黑衣大神）采用禅让制的传承方式，由上一位天王（大神）选好接班人传承接续。可见，黑色玉女军的宗旨为黑衣社所承袭，并对黑衣社的高层架构产生了制度性影响。与此同时，直至黑衣天王“小桃”的时代，黑衣社的核心也仍然沿用了一名天王（大神）与八名圣骑士（大护法）的架构，与黑色玉女军基本相同，只是以王蔷担任坤位圣骑士（大护法），所以并非全员女性，但王蔷以外的其余七位圣骑士也都由女性担任。另外，女性也占据了黑衣社包括队长在内的一些中高层职位，这都可以被视为黑色玉女军的延续。

黑衣社最终被狄仁杰等消灭，这同时也宣告了黑色玉女军的彻底覆亡。黑色玉女军的成员中，黑衣天王“小桃”和乾位圣骑士薇儿服毒自尽，震位圣骑士小娟等被逮捕。