黑山研究所，英文名Black Mesa Research Facility，简称黑山基地或B.M.R.F.，是黑山集团的总部所在地。黑山研究所是第一人称射击游戏《
半条命》及其三个官方资料片（针锋相对、蓝色行动、衰变）剧情的主要发生地，同时也是《
半条命2》剧情的起源（详细参见“
七小时战争”条目）。该研究所坐落在美国
新墨西哥州沙漠中。
在2003年5月16日，C区
反物质实验室（c-33/a）的一次失败实验导致了Xen生物的入侵，研究所设施被
严重破坏，政府派出
海军陆战队和黑衣人部队对整个事件进行封锁。事件的最后，整个黑山研究所被
G-Man引爆的
核弹所“自我了断”。（但在《半条命2：第二章》中提到别的地方仍能收到黑山的通信讯号，其中未提到黑山被核爆）
黑山事件中，主角
戈登·弗里曼博士杀死了Xen的主管者尼赫伦斯，使联合帝国（《半条命2》中的主要反派）发现了地球，并发动了“七小时战争”击败人类。至此，人类被联合帝国控制，并由此引发《半条命2》和《半条命：爱莉克斯》的剧情。
黑山研究所的雇员主要包括三部分：科学人员和安保人员和包括
行政人员、
服务人员和一些雇员的家庭的
其他人员。
（PS：仅限于以下游戏：《半条命》《
半条命：针锋相对》《
半条命：蓝色行动》《半条命：衰变》以及第一代的非官方重置版《黑山研究所：起源》(即《BLACK MESA》)）
《黑山研究所：起源》或《BLACK MESA》（使用
起源引擎的<半衰期>非官方
重制版）