事后，当黄作孚出任山西高平县知县时，
严嵩亲自设宴为他送行，被他毅然拒绝。黄作孚在
高平任知县二年，“伦谊平居，冲寂自好。乃遇应事时，不辞焦劳，有就厥功”。《高平县志》谓其“临政宽缓，任人不疑”。后来，
严嵩的党羽刘某到山西巡视，策动黄作孚属下对其诬告，终被罢免。黄作孚卸任回乡时，行李简陋，连回乡的路费都是他的同事资助的，离任后，高平人如失怙恃。黄作孚回乡后，与乡人讲求古礼，振兴墨邑文物。他乐善好施，誉满乡里。其姑母家境贫困，老年无依无靠，黄作孚把她接到家中，待以母礼。多年前吴家卖了20亩地给黄作孚家，后来吴家败落，吴氏子到处流浪，黄作孚把他找来教育安慰后，把那20亩地的地契无偿还给了他，吴氏子感激得痛哭流涕，此后，努力耕作，得以安居乐业。燕人刘棻携带亲眷千里来到即墨赴任(司训)，刚到10天，亲眷就去世了，他人生地不熟，又领不到俸禄，就打算将亲人尸体就地掩埋。黄作孚知道后，为他买了棺材，并动员一些有钱人家共同为他筹集了数十金，使刘棻得以返乡处理丧事。当时，城区贫穷人家死了人都乱埋在附近沟壑，暴骨相望，黄作孚出钱买地，捐出来作为公墓。