鹿本郡是日本熊本县辖下的一个郡，已废除。废除前的辖区还曾包含合并后的山鹿市大部分地区以及熊本市的部分地区。

1896年04月01日：实施郡区町村编制法，山本郡和山鹿郡合并为鹿本郡，合并后下辖：山鹿町、川边村、八幡村、平小城村、三岳村、三玉村、米田村、大道村、来民町、中富村、稻田村、岩野村、广见村、岳间村、六乡村、内田村、千田村、米野岳村、山内村、植木町、吉松村、山本村、樱井村、山东村、田原村、菱形村、田底村。（3町24村）

1954年04月01日：（2町15村）

山鹿町、大道村、三玉村、八幡村、三岳村、平小城村、川边村、米田村合并为山鹿市，并脱离鹿本郡。

岩野村、岳间村、广见村合并为鹿北村。

1955年04月01日：（2町12村）

六乡村、内田村与菊池郡城北村合并为菊鹿村。

来民町、稻田村、中富村合并为鹿本町。

1955年01月01日：植木町、吉松村、山本村、樱井村、山东村、田原村、菱形村合并为新设置的植木町。（2町6村）

1955年07月01日：米野岳村、千田村、山内村合并为鹿央村。（2町5村）

1963年12月01日：鹿北村改制为鹿北町。（3町4村）

1965年10月01日：菊鹿村改制为菊鹿町。（4町3村）

1965年11月01日：鹿央村改制为鹿央町。（5町1村）

1969年04月01日：田底村被并入植木町。（5町）

2005年01月15日：鹿央町、鹿北町、鹿本町、菊鹿町与山鹿市合并为为新设置的山鹿市，并脱离鹿本郡。（1町）

2010年03月23日：植木町被并入熊本市。