鲸头鹳科(Balaeniciptidae)是
鹳形目的一科。鲸头鹳科仅鲸头鹳一种，只分布于非洲大裂谷一带的有限地区。鲸头鹳的喙宽大而粗壮，嘴端下弯成勾状，体型高大，头尤其巨大，让人想起已经灭绝的
营穴鸟。
鲸头鹳身长可达150厘米，成年鸟羽主要为灰色，幼鸟的羽毛主要为棕色。鲸头鹳生活在非洲东部热带地区
苏丹共和国和
赞比亚的巨大沼泽地区。
鲸头鹳的分类很有争议，传统地它被分为
鹳形目，在
鸟类DNA分类系统中许多传统不相关的鸟类全部被收录入了鹳形目。最近也有些学者使用
比较解剖学的方法认为它与
鹈鹕比较接近，其他学者则使用生物化学的手段认为它比较接近
鹭科。