2006年版电视动画《魔法老师！？》改编自日本漫画家
赤松健原作的漫画《魔法老师！》，由
SHAFT和GANSIS共同制作。该版本在2006年10月4日至2007年3月28日期间在东京电视台播出，总共26集。2006年新版TV动画的故事内容可以说是独立于漫画版及2005年版本的，除了涅吉被梅尔帝亚纳魔法学校派往麻帆良学园实习的一段之外，其余的都和漫画版及2005年版本有很大情度的分别，在人物关系方面和学校方面都对当初的设定进行了不小的更改。
在英国某间魔法学校修行的首席毕业生涅吉，目前还只是个虚岁10岁的少年。他的目标是成为“出色的魔法使”。魔法学校给涅吉指定的结业课题是“去日本普通学校当老师”！于是，涅吉在祖父的朋友的帮助下进入了麻帆良学圆，担任起有着31名女生的中等部2年A组的老师。按照魔法使世界的传说，在魔法使的身边都会有一个保护着他的勇敢战士存在。这种帮助魔法使的伙伴被称为“魔法使的从者”。由于涅吉还只是个孩子，所以年幼的他尚未签订这种契约。但在进入麻帆良学圆后，涅吉还是意外的通过KISS的方式与一位名叫神乐坂明日菜的女生定下了契约。从现在开始，一声妙趣横生的大骚乱似乎即将展开。
由于XEBEC制作的版本引来各方批评，令赤松健和另一间动画公司SHAFT合作，首先推出的就是为再度改编成电视动画的《魔法老师！？》预热的OVA动画。该OVA共两话，分别是《春版》和《夏版》，此次作品的原创内容比较多。《春版》首先在2006年4月23日举办的特别活动“魔法老师·麻帆良学园中等部3-A 1学期开学式”上现场放映，并于2006年10月25日推出DVD。《夏版》同《春版》一样，在2006年9月17日举办的特别活动上现场放映，并于2006年11月22日推出DVD。
OAD《魔法先生!～白翼 ALA ALBA～》讲述涅吉在魔法学园毕业，作为见习魔法使的修行而来到日本的麻帆良学园担任女子初中部2年A组的班主任，经历了各种混乱事件后，涅吉和学生们迎来了最后一年的初中生活。新作的事件背景设置在漫画版中升上初三后、结束了修学旅行和学园祭之后，主要讲述的是学生们的暑假生活。这次等待着涅吉及31名少女的又是什么奇怪事件呢？
OAD《魔法老师！ 另一个世界》是《魔法老师》的第二部OAD动画，全4集，于2009年9月至2010年8月间随含特典的漫画单行本限定版附送，接续第一部《魔法先生!～白翼 ALA ALBA～》之后的故事开始，也就是将进入《魔法世界篇》的内容。该部OAD讲述的是在涅吉的带领下，全班同学都跟随依文进行着严酷的修行。当修行结束后，为了寻找涅吉的父亲纳吉，大家来到了涅吉的故乡威尔士，原本大家抱着去郊游般的轻松心情，谁知道等待着他们的，却是涅吉宿命的对手菲特。
OAD动画《另一个世界 Extra 魔法少女夕映♥》是以系列第8回人气投票排名第一的“绫濑夕映”（CV：桑谷夏子）为主角展开的故事。剧中绫濑夕映失去了原本的记忆，以夕映・Farandole的身份成为魔法骑士团候补生与涅吉一行人之间的邂逅的故事。该外传OAD随2010年11月17日发售的第32卷限定版推出。
漫画《魔法老师neo（ネギま!?neo）》由日本漫画家
藤真拓哉作画，自讲谈社旗下的《月刊COMIC BOMBOM》2006年11月号开始连载，伴随《月刊COMIC BOMBOM》于2007年11月号后休刊，漫画移籍到《Magazine Special》2008年No.2（1月20日发售）-2009年No.9（8月20日发售）。单行本由讲谈社出版，繁体中文版由东立出版社代理发行，全7卷。