高邮港位于
高邮经济开发区内，位于
京杭大运河高邮段东侧，最大停泊能力为2000吨级，
公铁水联运码头紧邻扬州铁路货运站，规划成为公路、铁路、水运联运的综合性货运站。
扬州港高邮港区城北作业区码头的建设，将显著改善和提高京杭运河高邮港区的运输能力和服务水平，对高邮市实施工业化、外向化、城市化发展起到推动作用。同时也是加速大运河产业带发展的重要举措。
城北港区是大运河高邮港的主港区，拟规划城北港区位于
高邮经济开发区外环路产业带，服务于
高邮城区、东片工业区和
马棚镇建设；具备货物装卸、仓储、中转及物流功能的综合性公用码头，兼顾发展临港工业功能。
城南港区是大运河高邮港的副港区，拟规划城南港区位于
高邮城南经济新区南外环路运河大桥以南，服务于高邮城南及周边村镇，具备货物装卸、仓储、中转功能的公用码头。
界首港区是大运河高邮港的副港区，拟规划界首港区位于
界首镇区，服务于沿大运河界首片区，具备货物装卸、仓储、中转功能的公用码头。