高性能计算系统是一种用于信息科学与系统科学、物理学、工程与技术科学基础学科领域的计算机及其配套设备，于2016年5月13日启用。

服务器：1. 计算节点机箱（刀片式）:机箱高度10U全模块化设计。机箱深度0.847米,10U 14片箱体，配置1个56Gbps IB网络模块，对外16口上联； 1个万兆以太网交换机模块，对外支持8端口万兆上联端口。2500W高效电源模块，电源转换效率90%；全N+N冗余；电源模块数量6个，标配热插拔、冗余的风扇模块，支持N+N，风扇数量8。1个管理模块。2. 计算节点：Lenovo X240 M5，2*E5-2690v3 30MB Cache,12C,2.6GHz,QPI 9.6GT/s,135w,1*300GB 10K 6Gbps SAS 2.5 G3HS 硬盘，8 x 8GB TruDDR4 内存 (1Rx4, 1.2V) PC4-17000 CL15 2133MHz LP RDIMM，Flex System EN2024 4-端口 1Gb 以太网 适配器Flex System IB6132 2-端口 FDR Infiniband 适配器。3. 集群管理节点：x3650 M5,2U机架式服务器，二颗至强处理器E5-2630Lv3 1.8GHz 8核,8*8GB TruDD。

核心交换机采用8台36端口FDRIB 交换机，总计提供288 个IB 端口；16 个刀片机箱IB 交换模块，每个交换模块连接16 根IB 线缆，分成8组，每组2 根，分别上连至8 个核心交换机；做到14 对内16 对外，1614，全线速无阻塞；单独采用两台36 端口IB 交换机，用于连接6 台I/O 服务器（需要12个IB 端口）、磁盘阵列（需要4 个IB 端口）、2 台管理节点、2 台登录节点，每台交换机上联2*8=16条IB线缆，16对外，16对内（两台IB交换机目前总计使用了12+4+2+2=20个端口），也做到全线速无阻塞；SFA7700X磁盘阵列连接到两台边缘交换机，每个交换机。