马文奎，男，1958年10月出生，山东沂水人，教授级高级工程师。1991年9月加入九三学社。

1982年1月毕业于河海大学水文专业，获工学学士学位。

1982年2月至2011年5月，先后在海委水文处、科技外事处、防汛抗旱办公室、水管处、水资源保护科学研究所、防汛抗旱办公室工作，历任防办副主任、水管处处长、水科所所长、防办主任等职（期间：2008年6月至2011年5月，兼任海河防汛抗旱总指挥部办公室常务副主任）（1984年9月至1985年7月，在南开大学计算机应用高级软件班学习毕业； 1992年2月至8月，在捷克布拉格农业大学国际高级水文进修班学习毕业。）

2011年6月起任海委漳河上游局副局长。

2016年7月—— 2018年12月，任水利部海河水利委员会海河下游管理局副局长、党委委员。

1998年1月起当选为天津市河东区第十三、十四、十五届人大代表。2011年起任九三学社天津市河东区第五届委员会常委。

2011年6月2日，漳河上游局召开干部大会，宣布马文奎任漳河上游局副局长。

2016年7月，中共水利部党组决定：任命马文奎为水利部海河水利委员会海河下游管理局副局长、党委委员，免去其水利部海河水利委员会漳河上游管理局副局长职务；

2018年12月17日，中共水利部党组决定：免去马文奎的海河水利委员会海河下游管理局副局长、党委委员职务。