原名妈娘宫，位于澎湖马公镇，始建于元至元十八年 (1281年)，因朝廷官兵蒙妈祖救助而建。

明嘉靖年间(1522—1566年)俞大猷重修妈娘宫，以庆抗倭胜利，明万历二十年(1592年)再次重修。现存建筑是康熙年间(1662—1722年)重修的，迄今也有三百多年的历史，也算是台湾最古老的妈祖庙了。相传康熙二十二年(1683年)施琅进攻澎湖时得到妈祖显灵助战，因而被康熙帝敕封“天上圣母”称号，并颁赠“神昭海表”匾额一块。此后妈祖在台湾便成为“有求必应、神通广大”的神灵了。现在宫内仍保存大量的古碑、古匾、古联、古井(即万军井，又名妈宫大井)等文物。