顺治七年(1650)三月,迁湖广
布政使。七月,擢
陕西巡抚。土寇王才据
终南山肆掠,马之先遣
游击陈明顺等自
子午镇进剿,王才窜走,败之高关峪,又败之化羊峪,获王才。
河南贼何柴山,溃走
陕西,入土贼
程福亮营,马之先招降程福亮,擒何柴山,又剿贼孙守金、唐珍玉等,余寇悉平。
顺治十一年(1654),李自成馀党
刘二虎、
郝摇旗等侵入陕西境,马之先与汉兴总兵赵光兴发兵三道迎击,贼败入
竹山,据小广峪寨,我兵合围奋剿,覆其巢,阵斩伪总兵傅奇。十月,迁
宣大总督。题改
阳和府仍为阳和卫,修
大同府城如制。
顺治十三年(1656)五月,疏言大同民贸易专用钱,故徵粮银钱兼收成规已久。若遵部文尽徵银,於民不便,请酌徵钱配兵饷,部议从之。寻调
川陕总督,命加
兵部尚书衔。六月,
入觐,赐冠服、鞍马,上谕之曰:“尔以素望,堪任斯职,故行特简。尔受事后,务实心供职,兴利除害。陕西乃天下咽喉要地,尔须较前任总督
孟乔芳,倍加勤慎,方克有济,毋使天下谓朕不知人也。”九月,疏报流贼
张献忠余党冉秉乾等投诚,请照例安置,报闻。