丈（
余文乐饰）是特别职务队（俗称放蛇）警员，驻守于深水埗——一个类似于当年的九龙城堡的充满着暴力血腥肉欲横流的世界，而他常与黑帮、妓女为伍，生活也没什么目的，像是一个古惑仔。在众多妓女当中，他喜欢上了lulu（冼色丽饰）但他觉得这不是爱情，甚至不是怜悯，只是丈对着lulu时，总有一种能安心睡一觉的感觉。正当丈自以为可以如此的得过且过生活下去的时候，却被卷入了一连串的黑帮恩怨里，因为黑帮大家姐斩妈（
邵音音饰）儿子阿奇在死对头四眼堂（
廖启智饰）地头内失踪，连同阿奇偷运进境的罕有绿宝石也不知所踪，斩妈知道丈与四眼堂有联系，迫丈代为出面与堂交涉，但在交涉时丈意外地错杀四眼堂，而唯一的目击证人则是试图杀四眼堂的杀手。几个低等烂命的人，一场在深水埗的黑暗战争正式牵起了战幔。谁的生命力最强，谁就是最后的胜利者。
导演郭子健居住在香港的一个旧区深水埗，他此前写过的剧本几乎都是在深水埗的家居中完成，而他想拍一部关于深水埗的电影，他也就选择了妓女、古惑仔、乞丐与印巴人这四类曾经长期出现于深水埗的职业者作为《青苔》的主要人物的身份，再配上待拆大厦、阴暗后巷等这类颓废且糜烂的场景。而影片的名字“青苔”也正是生活在这种潮湿阴暗的地方的典型生物，导演认为青苔是很低等的生物，要在潮湿且暗的地方才可以生存，就如深水埗。
在最初构思本片时，“青苔”本来是影片的主角的名字，来自于编剧司徒锦源的想法：青苔是一个生命力特别强的古惑仔，是那种你别想踩我，否则必定报复的人物。不过，后来郭子健逐步的强化影片的概念时，觉得一个人不够代表，于是试图将其发展成为一个群体，延伸至深水埗的一群富有生命力的各色人物，几乎都是生活于阴暗地带的边缘人。
《青苔》的黑色是浓血凝聚而成，在这底色上呈现的，是游走在社会边缘挣扎求生的小人物，面对暴力血腥物欲横流的世界，每个人都有一套生存哲学。本片的最大亮点在于，郭子健把个人的黑色风格与主流动作类型糅合得恰到好处，而他最显眼的个人风格，则是把童话纯真的亮调掺入黑色的底色，让影片增添一份浪漫温馨的情调，而不至于过分灰暗。正如在一场场惨烈紧张的厮杀搏斗之后，最打动人的，是乞丐杀手对女孩阿花的那份温情（南都网评）。
《青苔》讲述了香港社会底层一些小人物的心灵纠葛，虽然有很多打斗镜头，但是暴力并不是这部电影的主题，爱才是这部电影想要阐述的主旨，而这正是影片的成功之处（时光网评）。