1992年，陈为军从四川大学新闻系毕业后在武汉电视台工作。1994年，开始从事纪录片创作。1999年，与斯泰西·佩拉塔、弗朗索瓦·维特斯特等联合执导个人首部纪录片《独立镜头》。2004年，执导艾滋病题材纪录片《
好死不如赖活着》，该片获得英国国家最佳纪录片奖、美国广播电视文化成就奖皮博迪奖。
2007年，执导纪录片《
请为我投票》，该片讲述了中国小学生班级选举的故事，入围奥斯卡最佳纪录长片单元，获得亚什兰独立电影节最佳纪录片奖。2008年，执导纪录片《
世界最大的中国餐馆》，该片是一部关于湖南“西湖楼”饭店（座位5000，员工1000）的记录片。2011年，执导纪录片《Law of the Dragon》。
2012年，应日本NHK之邀前往日本东京拍摄纪录片《日出日落》，该片讲述了住在涩谷的年轻人群体和居住巢鸦的老年人夫妇的生活；同年，与多位导演联合执导纪录片《
为什么贫穷？》；随后，自编自导纪录片《中国梦》；此外，还执导了纪录片《出路》，该片讲述了贫困家庭读书谋出路的故事，获得美国广播电视文化成就奖。
2016年12月16日，由其执导的纪录片《
生门》上映，该片聚焦每一个家庭都会面临的生育问题，纪录了4位遭遇极端情况的产妇及其家人在医院生产过程中经历的种种考验。2017年，执导由李家福、夏锦菊等联合主演的系列纪录片《生门》。
2020年8月28日，由其执导的纪录长片《城市梦》正式公映。该片主要讲述两个群体的故事：一边是为了留在城市生活的小贩，另一边是为了城市发展的城管，影片通过展示两边各自的城市梦所产生的矛盾，展现了城市管理人员工作的不易与中国人蓬勃发展的“城市梦”。
陈为军将敬畏生命作为创作理念贯穿自身纪录片创作的全过程。他在拍摄纪录片时始终坚持着敬畏生命的理念，他的每一部作品都是从生命最本质的角度出发，从选题、拍摄过程以及后期的剪辑制作，都凸显了他对生命的尊重和对生存权利的关注，表达出强烈的人文关怀和社会责任感。他在做一部片子之前，都会反复思考拍摄的意义。他所遵循的原则是使不同的人种不同的文化背景下的人都可以看得懂，可理解。除了在拍摄纪录片时所坚守的生命价值和独立精神之外，陈为军个人也蕴藏着作为一名新闻人强烈深厚、忧国忧民的社会责任感与人文关怀精神。在拍摄纪录片《好死不如赖活着》的过程中，陈为军虽然面临无数困难和险阻，但是凭借着过人的毅力和坚持不懈的精神，他克服了压力和困难，才成功地将马深义一家的生活现状呈现在公众面前（华中师范大学薄云娜评）。