1996年,执导个人首部电视剧《城市稻草人》。1998年,执导现代农村剧《
班禅东行》,该剧获得中国优秀电视剧研讨会“特殊贡献”奖、“五个一工程”奖和奔马奖一等奖。1999年,执导亲情剧《奶妈》。
2001年,执导反贪史的纪实政论剧《
共和国反贪风云》,该剧用现场采访和纪录相互动的手法,展示了建国五十年中典型重大案犯的罪行。
2003年,执导由
陈建斌、
李洪涛联袂主演的乡村革命剧《
走进八里堡》,该剧获得第24届中国电视剧飞天奖三等奖。2004年,执导情感都市剧《
将装修进行到底》。
2005年3月20日,执导的古装推理悬疑剧《
大宋提刑官》播出,该剧讲述了世界法医鼻祖宋慈“人命大如天”的断案生涯;同年,执导由
寇振海、
于慧联合主演的情感剧《
金达莱》。2006年,执导的电视剧《
大宋提刑官2》播出,该剧由
王庆祥、
陶泽如、
刘敏涛联袂主演。
2007年,执导古装神话剧《
吴承恩与西游记》,该剧获得比利时第一届国际3D电影节最佳创新奖、澳门国际数字电影节优秀电视剧奖。2011年,执导战争剧《
兄弟海》,该剧以唐家四兄弟“情仇恩怨”“台海战事”为主题故事,阐述了“同祖同根血脉连,大陆台湾都是家”的主题。
2014年,执导由
王子文、
林雨申合作主演的青春励志剧《
青春无季》。2015年,执导由
赵本山、
小沈阳共同主演的乡村情感剧《
爹妈满院》,该剧讲述了张广利面对父亲濒临倒闭的酒厂,毅然回村帮助父亲拯救酒厂的故事。
2016年,为纪念乌兰夫诞辰110周年、庆祝内蒙古自治区成立70周年,执导了传记剧《
英雄出草原》。2017年,执导由
吴京安、
徐僧、
孙宁联合主演的古装剧《
天下粮田》,该剧为《天下粮仓》的姊妹篇。2018年,执导农村题材剧《
一号文件》,该剧改编自莫伸的同名报告文学。
作为农村题材主旋律作品“专业户”的导演阉卫平,他主张“皮薄肉厚” 。纵观阉卫平的作品,包括他的电影《城市稻草人》和电影《班禅东行》 等,所有电视剧的开头抛弃了慢慢交待有关人物事件和人物关系的叙事习惯,回避和搁置了有关矛盾冲突与感情纠纷等复杂因素的追根溯源,往往一开头就是刮着风,下着雨,闪着电,吼着雷。正是由于注重自己作品开头的悬念设置和因果链结构,阉卫平的许多电视剧从一个真正的、有进展的动作构成的开端切入进去,常常能丝丝入扣,环环相逼地推进到结尾的高潮处,观众一看就喜欢,喜欢上就放不下(《当代电视》评)。