闽清站原是外福铁路也称
来福铁路的车站，自福建
南平市来舟南侧的四等小站外洋起至
福州站。于1956年3月开始动工，1959年4月全线建成，12月1日零时起交付国家正式营运，闽清站同期开始启用。并入国家铁路网后，闽清站属上海铁路局
福州铁路分局管辖。
2004年5月，福州铁路分局整建制划入南昌铁路局，闽清站改属南昌铁路局福州铁路分局管辖，2005年全路裁撤铁路分局后，闽清站改属南昌铁路局福州车务段管辖，现为四等站。
在中国铁路第六次大提速过程中，铁道部决定将部分铁路老线进行更名，并于2006年12月31日18时起实行统一贯通里程，
横南铁路、
外福铁路福州—南平南段正式更名为
峰福铁路，原外福铁路南平南—外洋段改称
外南铁路。