门头沟区疾病预防控制中心（简称疾控中心）于2002年3月正式成立。2010年10月18日，疾控中心新的卫生防病业务楼正式投入使用，拥有万元以上仪器设备100余件，具有计量认证资质，具备7类248个项目的检测能力。
职责
主要职责：开展疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测检验评价、健康教育与健康促进、技术管理应用研究指导，是区政府卫生防病工作技术保障部门和疾病预防控制服务专业机构。
科室
疾控中心内设流行病科、计划免疫科、性病艾滋病控制科、结核科、健康体检科、微生物检验科、理化检验科、综合评价科、健康教育科、慢病科等10个业务科室以及办公室（含总务科）、质量管理科、财务科3个职能科室。
地址
邮政编码：102300
乘车路线：乘坐336路，或383路、运通112路、961路、941路、972路， 在城子站下车，沿城子东街走290米，到达终点。
荣誉
2020年11月20日，被中央文明委评为第六届全国文明单位。
2021年6月，门头沟区疾病预防控制中心党支部被授予“北京市先进基层党组织”称号。