神武天皇大军行进至速汲门，遇到一名坐在龟甲上钓鱼之奇人，问其名曰豆毗古。神武天皇纳为家臣，赐名槁根津日子，该家臣谙水性熟海道，引领大军从浪速国之渡口坐船至青云之白肩津。此时登美能那贺须泥毗古早已整军待战，双方鏖战时神武天皇之兄五濑命的手遭到对方流箭射穿。他受伤濒死时对神武天皇说：“我们是日神之子，不该面对日出的东方，应该要背对太阳才对。”遂遵照指示向南迂回前进，中途在海边清洗五濑命手臂上的血，至纪伊国（今和歌山县）男之水门时五濑命身亡，葬于纪伊国灶山。

神武大军耗时半年途经筑紫（今福冈县）、安艺（今广岛县），然后驻扎在吉备（今冈山县）养精蓄锐三年。接下来继续朝东，经浪速国、河内国（今大阪府东部）后，于孔舍卫坂遭遇土豪长髓彦顽强抵抗，神武长兄五濑命遭流箭伤及肱胫。神武天皇意识到身为日神子孙，朝着太阳升起的东方征虏乃逆天道，遂令全军后退，并绕道纪伊（今和歌山县）前进。途中五濑命因箭伤身亡，葬于纪伊灶山。

后来神武大军与长髓彦军鏖战多时却无法取胜，战况陷入泥淖之际飞来一只金色灵鸱停于神武天皇之弓弭，其耀眼光芒令敌军士卒迷眩无法再战。为报五濑命箭伤身亡之仇，神武天日军队穷追不舍，长髓彦派人前来解释原委。原来其妹婿饶速日命乘天磐船自天降，为天神之子，而神武天皇亦自称天神之子，他不相信天神子有两个。神武天皇则质疑饶速日命若为天神子，应有代表物，于是长髓彦出示饶速日命佩带的天羽羽矢及步鞬。饶速日命明白长髓彦仍对神武天皇怀有敌意，乃杀之，并率部众归顺神武大军，最后神武天皇总算在大和定居下来。

虽然《日本书纪》记载长髓彦乃被饶速日命杀死，但自称是长髓彦后裔的矢吹氏却相信并非如此；旧添下郡鸟贝郷（今生驹市北部、奈良市富雄一带）或樱井市附近的豪族亦流传着同样的说法。