铁路集装箱形式进行的货物运输，是铁路货物运输的种类之一，列车为集装箱列车。1853年美国铁路企业开始办理集装箱运输，但由于各部门使用的箱型不同，管理分散，未得到发展。
第二次世界大战时期，美国为了安全、迅速而简便地输送军用物资，大量采用集装箱运输。战后各国相继发展了铁路集装箱运输。中国铁路集装箱运输重点是解决铁路零担货物运输，主要采用1吨和5吨通用集装箱。随着铁路集装箱运输和拖车式集装箱运输的发展，铁路集装箱运输组织工作也获得新的发展，编开了集装箱定期直达列车和集装箱专用列车，双层集装箱列车。
1965年11月，英国开始在伦敦和
格拉斯哥之间编开了
集装箱定期直达列车。这种列车定点、定线、定期、固定车底，循环运行于两个基地站间，不需重新编组，因此运行速度快、效率高。美国开行集装箱定期直达列车的运行速度通常与旅客列车相同，利用电子计算机编制计划、掌握运输情况和
动态、处理运输报告和控制集装箱的装卸等，实现了全部作业过程的自动化。日本、联邦德国、法国，爱尔兰、丹麦、西班牙、民主德国和波兰等国铁路也相继编开了这种列车。对于零星运送的小批量的集装箱，往往不能为集装箱定期直达列车所吸收，但又急需及时运送时，则可编入快运货物列车进行运送。
集装箱直达列车开行对集装箱运输的发展起到了很大的作用。但各个国家，各个不同发展时期组织
直达列车的形式也不尽一致。集装箱直达列车应如何组织要根据国家陆域的大小，主要资源的分部、铁路运输设备等情况加以确定，并贯彻运送速度快、服务质量优、运营成本低的原则。
一般是指在港口站编组开行的列车。当
集装箱船到达港口时，在24小时内即可卸空，除到达港所在地区和近距离的集装箱可由汽车输送外，运程较远的集装箱则组织集装箱专运列车运送。由于集装箱船航行易受天气等自然条件的影响，到港日期不很准确，集装箱的去向和到站又不一致，因此，集装箱专用列车虽在列车运行图上有专门的运行线，但只能不定期地编组开行。
集装箱专用列车与定期指直达车的相同之处在于都在铁路运行图上有专门的运行线，不同之处在于专运列车虽然也是大批量的集装箱和运输较长，但不是定期的，这种运输可以解决货源不均衡或者船期不定的矛盾。
双层集装箱列车 或铁路双层集装箱运输 的出现是集装箱运输史上的一次革命，它可以使单位运营成本降低25%-40%，同时能使运能提高30%以上，是我国铁路货物运输的发展方向。我国铁路双层集装箱运输的运营还处于初始阶段。