野生株
病毒类型
野生株基因:用M13mp18/gD2和M13mp19/gD2野生株重组噬菌体上清转 染TG1制备单链模板,从两个方向测定野生株gD基因序列。在复旦大学遗传所ABI373A自动测 序仪上进行测定,综合测序结果即得到HSV-2野生株gD基因序列
简介
全世界人口中70%的人血清疱疹病毒抗体阳性,超过三分之一的人有复发性H SV感染。本例患者(野生株)有5年生殖器疱疹的复发病史,经多种抗病毒药物治疗无效。分 析其核苷酸序列发现HSV-2野生株gD基因片段第235bp和第474bp处发生了T-C、C-T的有意 义突变。gD基因编码的氨基酸序列有两个变异,在第80位V(赖氨酸)-A(丙氨酸),第159位I (异亮氨酸)-T(苏氨酸)有变异。该病例反复发作,久治不愈,考虑与其gD基因的核苷酸和 氨基酸突变有关。有待更多的复发性HSV-2gD基因序列做进一步的证实和探讨。
野生株基因片段的酶切图谱
扩增及鉴定
野生株基因的扩增及限制性内切酶鉴定
利用合成的引物,以HSV-2野 生株及标准株DNA为模板,通过PCR扩增gD基因,得到了含646基因片段的PCR产物,其大小与 预期值相符,未发现非特异性条带。根据已发表的HSV-2G株gD基因中含有SalⅠ酶切位点, 将扩增的HSV-2野生株及HSV-2 Sav株用SalⅠ酶切分别得到264bp和464bp的酶切产物。野 生株酶切片段与标准株相符(图1)。
计算机分析
野生株gD基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列的计算机分析是利用PCGENE软件 在计算机上进行的。
参考资料
[3]肝胆相照网
[4]佐罗网
参考资料
最新修订时间:2024-06-11 17:36
目录
概述
简介
扩增及鉴定
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