重庆市畜牧科学院畜牧工程与食品加工研究所是经重庆市编委批准在重庆市畜牧科学院建立的一个专门从事畜牧工程与畜禽产品加工及其相关技术、工艺研究与推广应用的公益型研究所。
现有综合办公室、畜牧工程研究室、食品加工研究室、技术咨询服务部四个部门。目前拥有固定员工7人，其中研究员、教授3人，副研究员3人，初级
专业技术职务人员1人；享受国务院特殊津贴待遇的专家2人，市级学科带头人1人，本所名誉所长李保明教授现任中国农业工程学会畜牧工程分会理事长，
中国农业大学博士生导师。
本所近期内主要工作职责是从事规模化畜禽场的优化设计；规模化猪场配套设施、设备的优化研制与开发；高温高湿地区规模化猪场母猪舍饲散养清洁生产工艺研究；高温高湿地区新型环保养猪工艺研究；炎热气候区畜舍环境调控技术的国际合作研究与推广应用；肉制品深加工、贮藏保鲜新技术研究与推广应用；中式传统特色肉制品的现代化研究与推广应用；替代
亚硝酸盐的新型天然腌制剂研究；猪源性生物材料的研究；畜禽副产物深加工与综合利用技术研究与推广应用。
本所以提高我国畜牧工程和食品加工科学技术研究水平和创新能力为目标，愿与业界同仁携手促进畜牧工程和食品加工科学技术的进步与科技成果转化，推动重庆、西南乃至全国畜牧工程和食品加工产业持续、稳定、健康发展。
