重庆市医疗保障局，是将市人力资源和社会保障局的城镇职工和城镇居民基本医疗保险、
生育保险、新型农村合作医疗职责，市物价局的药品和医疗服务价格管理职责，市民政局的医疗救助职责等整合，组建的，作为市政府直属机构。
主要职责
（一）贯彻执行国家医疗保险、生育保险、医疗救助等医疗保障制度的法律法规、政策、规划和标准，拟订医疗保障地方性法规、规章草案，拟订相关规划、政策、标准并组织实施。
（二）组织拟订并实施医疗保障基金监督管理办法，建立健全医疗保障基金安全防控机制，推进医疗保障基金支付方式改革。
（三）组织拟订医疗保障筹资和待遇政策，完善动态调整和区域调剂平衡机制，统筹城乡医疗保障待遇标准，建立健全与筹资水平相适应的待遇调整机制。组织拟订并实施长期护理保险制度改革方案。
（四）组织制定药品、医用耗材、医疗服务项目、医疗服务设施等地方医保目录和支付标准，建立动态调整机制， 拟订医保目录准入谈判地方规则并组织实施。
（五）组织拟订药品、医用耗材价格和医疗服务项目、 医疗服务设施收费等政策，建立医保支付医药服务价格合理确定和动态调整机制，推动建立市场主导的社会医药服务价格形成机制，建立价格信息监测和信息发布制度。
（六）制定药品、医用耗材的招标采购政策并监督实施， 指导药品、医用耗材的招标采购平台建设。
（七）拟订定点医药机构协议和支付管理办法并组织实施，建立健全医疗保障信用评价体系和信息披露制度，监督管理纳入医保范围内的医疗服务行为和医疗费用，依法查处医疗保障领域违法违规行为。
（八）负责医疗保障经办管理、公共服务体系和信息化建设。组织拟订和完善异地就医管理和费用结算政策。建立健全医疗保障关系转移接续制度。
（九）完成市委、市政府交办的其他任务。
（十）职能转变。重庆市医疗保障局要完善统一的城乡居民基本医疗保险制度和大病保险制度，建立健全覆盖全民、城乡统筹的多层次医疗保障体系，不断提高医疗保障水平，确保医保资金合理使用、安全可控，推进医疗、医保、医药“三医联动”改革，更好保障人民群众就医需求、减轻医药费用负担。
（十一）与有关部门的职责分工。重庆市医疗保障局要建立与重庆市发展和改革委员会、重庆市卫生健康委员会、重庆市市场监督管理局、重庆市税务局、重庆市药品监督管理局等部门的沟通协商机制，加强制度、政策衔接，协同推进改革，提高医疗资源使用效率和医疗保障水平。
机构设置
内设机构
（一）办公室。负责机关日常运转，承担安全、保密、信访、机要、信息、档案、宣传、政务公开、后勤保障等工作。
（二）规划财务和法规处。拟订并组织实施全市医疗保障事业发展规划。承担医疗保障基金年度预决算草案编制、 审核。建立健全财务管理和内控制度。承担机关和所属单位预决算、财务核算、内部审计工作。推进医疗保障信息化建设，承担医疗保障统计工作。组织起草医疗保障地方性法规、规章草案。承担机关有关规范性文件的合法性审核和备案工作。承担本单位行政执法监督工作。承担行政复议、行政应诉等法律事务。
（三）待遇保障处。拟订医疗保障参保筹资和待遇政策。 建立健全与全市筹资水平相适应的待遇调整机制。承担城乡医疗救助、城乡居民大病保险和其他各项补充保险的管理工 作，建立健全覆盖全民、城乡统筹的多层次医疗保障体系。
承担医疗保障扶贫工作。建立完善医疗保障关系转移接续制度。组织拟订全市长期护理保险参保筹资和待遇政策并监督实施。
（四）医药服务管理处。拟订地方医保目录和支付标准， 建立动态调整机制。拟订医保目录准入谈判地方规则并组织实施。拟订定点医药机构医保协议和支付管理、异地就医管理办法和结算政策。组织推进医保支付方式改革。组织开展药品、医用耗材、医疗技术的经济性评价。
（五）医药价格和招标采购处。拟订药品、医用耗材价格和医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策，建立医保支付医药服务价格合理确定和动态调整机制，推动建立市场主导的社会医药服务价格形成机制，建立价格信息监测和信息发布制度。拟订药品、医用耗材的招标采购、配送及结算管理政策并监督实施。指导推进招标采购平台建设。
（六）基金监管处。拟订医疗保障基金监督管理办法并组织实施。建立健全医疗保障基金安全防控机制，建立健全医疗保障信用评价体系和信息披露制度。监督管理纳入医保支付范围的医疗服务行为和医疗费用，规范医保经办业务。 依法查处医疗保障领域违法违规行为。
机关党委（人事处）。负责机关党群工作，承担机关人事管理、机构编制、教育培训、队伍建设、离退休人员管理等工作。
直属单位
重庆市医药价格和招标采购监督指导中心
现任领导
（更新于2024年5月）
所获荣誉
2021年6月25日，重庆市医疗保障局机关党委（人事处）党支部被表彰为“市直机关先进基层党组织”。
地址
重庆市渝北区黄山大道中段5号水星科技大厦B4区