生殖隔离大致相当于从前所说的
生理隔离，与
地理隔离既有联系，也有区别。地理隔离由外因引起，而生殖隔离一般是在具有遗传差异（内因）的基础上才有可能（
遗传隔离）。同一地点的种、亚种的隔离完全是生殖隔离，但不同地点的种、亚种在许多情况下，似乎也会很快发生这种作用。关于生殖隔离，许多人进行过讨论。斯特宾斯（G.L.Stebbins，1966）作了如下的分类：（1）合子形成前的机制。（i）
生态隔离：虽在同一地域，但生态地位不同。（ii）
季节隔离：开花期有分离。（iii）行为性隔离（ethological isola－tion）：雌雄的性习性不同。（iv）
机械隔离：基于生殖器官构造的差异。（v）配子不亲和现象（gameteincompatibility）：一方的配子体在另一方的生殖器官内死亡。（2）合子形成后的机制。（i）杂种死灭或弱势（hybrid inviability，hybrid weakness）。（ii）杂种不育。（iii）杂种衰败（hybrid break－down）：F2以后死灭或弱势：
社会隔离能使群居动物脑的形态、激素水平以 及神经化学通路发生改变，进而使该动物表现出异 常的行为和生理特征，导致动物多动，攻击行为增加，在 新环境中缺乏正常的习惯化行为，前脉冲抑制 （prepulse inhibition，ppi）缺失等。在自然界中这些因子是重复地起着
隔离作用的。
因生殖方面的原因使亲缘关系相近的类群间不杂交，或
杂交不育，或杂交后产生不育性后代的现象。实质是不同种群内的个体，因受不同基因型控制而有不同的生殖行为及相关生殖率，故种群间的基因流动受到限制或被阻止。根据影响基因流动的障碍不同分为：①外在生殖隔离。基因流动的障碍是个体受精前外在的影响，包括机械隔离、行为隔离、季节隔离和配子隔离。如菊科莴苣属（Latuca）的L. canadensis和L. gra- minifolia，分布于美国东南部，人工杂交可育，但在自然界中，前者夏季开花而后者春季开花，得以保持两个个别的形态各异的生殖隔离种；②内在生殖隔离。基因流动受到个体内部的影响。由不同群体的配子体、配子、染色体或基
因间不能相互作用所致，包括不亲和性、杂种不存活、杂种不孕、杂种破落等4种隔离。如马（Equus caballus）和驴（E. asinus）杂交，不能产可育的杂种后代。地理隔离和生态隔离都含有生殖隔离的意义。生殖隔离是隔离的重要内容，是物种演化的一个因素和物种形成的必要条件。在成种过程中，一般先有地理隔离，后有生殖隔离。