配合力指一个亲本(纯系、自交系或品种)材料在由它所产生的杂种一代或后代的产量或其他性状表现中所起作用相对大小的度量。又称结合力、组合力。亲本的配合力并不是指其本身的表现，而是指与其他亲本结合后它在杂种世代中体现的相对作用。在杂种优势利用中，配合力常以杂种一代的产量表现作为度量的依据；在杂交育种中,则体现在杂种的各个世代,尤其是后期世代。配合力有一般与特殊之分，最早由G.F.斯普拉格和L.A.塔特姆提出。一般配合力 (gca)指一个亲本与一系列亲本所产生的杂交组合的性状表现中所起作用的平均效应。特殊配合力 (sca)指一个亲本在与另一亲本所产生杂交组合的性状表现中偏离两亲本平均效应的特殊效应。一个亲本的gca及sca是相对于一组特定亲本而言的，同一个亲本在另一组亲本中所表现的gca及sca可能与在原亲本组中的不同。

测定亲本配合力常用的方法有：

①自交系天然授粉后代试验；

②自交系与同一品种群体顶交后代试验；

③多系天然互交后代试验；

④双列杂交或两组亲本杂交试验。第4种方法不仅可测定gca效应,而且可测定sca效应。所谓双列杂交是p个

亲本间可能组合的交配设计,最常用的是不包括亲本本身及反交组合的一种。两组亲本p×q杂交，也称NCⅡ交配设计。每一自交系与其他一系列自交系所获的单交种组成这一自交系的半同胞家系，家系间的差异反映了自交系间的 gca效应。一个特定组合的效应扣除双亲配子 gca效应后的剩余值即离差，就是该组合两亲本间的特殊配合力效应。每一组合的表型值为yij=μ+gi+gj+sij+eij。式中μ为总体平均数,gi为亲本i的gca效应，gj为亲本j的gca效应，sij为亲本i与j间的sca。上式的限制条件是。

　亲本间 gca差异的遗传基础为基因的加性效应及部分加性×加性的互作效应； sca差异的遗传基础为显性效应、与显性有关的互作效应以及部分加性×加性的互作效应。在杂种后期世代所体现的 gca差异，其遗传基础与早代相同，而 sca差异则因显性及其有关的互作成分逐代降低，而主要为部分加性×加性互作效应。

配合力的大小可用以评定一个亲本材料在杂种优势利用或杂交育种中的利用价值（见数量性状遗传）。