宋代三司内部具有审计职能的机构还有都凭由司(后并归都理欠司)。《宋史》卷162《职官二》记载：“都凭由司以判都理欠司官兼，掌在京官物支破之事。凡部支官物，皆覆视无虚谬，则印署而还之，支讫，复据数送勾而销破之。”可见，凡盐铁、度支、户部三部所支官物，皆经审核其凭由无误，则盖印签发予以支领；有关机构支付后，再据其数报请核注销。说明都凭由司具有事前和事后审计两种职能，并审计凭证，而不同于三部勾院、都磨勘司的账簿审计。