郭祖深，襄阳人，南朝梁官员，以直言善谏著称于世。南梁将领。

南朝梁武帝初起时，以客从。后随蔡道恭在司州陷北，还为长兼南梁郡丞，徙后军行参军，擢为豫章钟陵令员外散骑常侍。普通末为南津校尉，加云骑将军。事见《南史·循吏·郭祖深传》。

梁武帝萧衍(公元502—549年在位)初起时，郭祖深为幕僚。后随蔡道恭在司州(今山、陕、豫等省各一部)，曾上书言边境之事，未被重视。后任梁郡丞、参军。萧衍夺取帝位后，提倡用佛教和儒学治世，朝政松弛。祖深上书说，当今“廉洁者自进无途，贪苛者取入多径，直弦者沦溺沟壑，曲钩者升进重沓……”(廉洁的人无路可走，贪污的人办法很多，直言的人受害，谄媚的人升官)。陛下昔日兴学读书，如今却“家家斋戒，人人忏礼，不务农桑，空谈彼岸”。当务之急，不能，“堕本求末”，而应“勤农桑者擢以阶级，惰耕织者告以明刑”。“如此数年，则家给人足，廉让可生”。他希望萧衍“去贪浊，进廉平，明法令，禁奢侈，薄赋敛”。

由于萧衍信佛，当时的都城(今南京)，有佛寺五百多所，都很富丽堂皇，有僧尼十余万，并拥有资产。至于郡县，更不待言。和尚有白徒(勤杂人员)，尼姑有养女，像这样的人几乎占人口的一半。因此郭祖深上书：“罢白徒养女”，“皆使还俗附农”。如此，“则法兴俗盛，国富人殷”。

郭祖深对用人、关津隘道整修方面，都诚挚地提出了自己的见解。萧衍虽未完全采纳，但认为他很正直，擢升为豫章钟陵(今江西省南昌市)令、员外散骑常侍。

普通七年(公元526年)，郭祖深任南津校尉，加云骑将军，秩二千石(郡守的俸禄)。

郭祖深为官公正严明，即使王侯势家出入津追，也要严加搜查。不畏强权，奏江州刺史邵陵王、太子詹事(辅导个子的三品官)周舍赃罪。远近侧目，不敢放纵，连淮南太守；也畏之如上司。

郭祖深生活简朴，常穿布衣，“食不过一肉”。“所领皆精兵”。每有征战，自率亲近先行，如有不进者，即斩。因此“威震远近，长江肃清”。