邵武清真寺是中国伊斯兰教清真古寺之一，创建年代说法不一。据当地穆斯林中流传，他们的族谱（已佚）曾记载，邵武最早的清真寺建于明洪武五年（1372），位于迎春坊诗话楼附近。

明嘉靖（1522～1566）初毁于火灾，隔5年后，穆斯林在现址重建1寺；而清光绪二十四年（1898）版《邵武府志》则记载：“邵武有清真寺，旧名清净，清雍正三年（1725）建。”考古人员根据寺的建筑结构属于清代工艺，大殿部分八角花卉柱础具有明代雕刻风格，认为该寺建于明代，翻修于清代。1957年和1983年人民政府两次资助重修该寺。

邵武清真寺古地约3000平方米，建筑结构属于清代工艺，大殿部分八角花卉柱础具有明代雕刻风格，现存的庭院布局类似中国四合院。入寺门后通过约20米的甬道，正中耸立一座木构宜礼塔，塔上望月楼为三层挑檐塔式小楼阁，上层为八角攒尖顶小亭。大殿木构屋盖作卷棚式，殿内两侧山墙有圆洞窗和圆拱窗。

邵武清真寺被列为市级文物保护单位，邵武市伊斯兰教协会、邵武市回民协会均设于此。寺内珍藏有元代硕石一块，明代铜制香炉一个，木刻版《古兰经》30本。

现存的庭院布局类似中国四合院。

入寺门后通过约20米的甬道，正中耸立一座木构宜礼塔，塔上望月楼为三层挑檐塔式小楼阁，上层为八角攒尖顶小亭。大殿木构屋盖作卷棚式，殿内两侧山墙有圆洞窗和圆拱窗。邵武市伊斯兰教协会、邵武市回民协会会址设于寺内。