连锁群法是利用近着丝粒距离基因的定位法 如果某一染色体上有一个离着丝粒距离较近的已知基因，另外有一个基因同样离着丝粒很近，可是不知道它是否属于同一染色体。把这样两个突变型品系进行杂交，如果这两个基因属于同一染色体，它们之间的重组频率不应超过两者的着丝粒距离之和。

如果不属于同一染色体，那么它们的重组频率应是50%(见连锁和交换)。由于这两个基因与着丝粒距离都是较近的，所以增加了这一判断的可靠性。用这一方法曾测得粗糙脉孢菌的连锁群数是7。遗传学研究中的一项基本工作;至于一个基因内部的突变位点的测定则一般称为基因精细结构分析。染色体基因定位方法多数也适用于染色体外遗传研究中的基因定位。