近海海洋环境科学国家重点实验室（厦门大学）（英文缩写MEL）依托厦门大学海洋与地球学院，于2005年3月启动建设，2007年6月通过科技部验收，2010年被评为优秀国家重点实验室。实验室拥有1个国家自然科学基金创新研究群体和1个教育部创新团队。
实验室现有固定研究人员46人，其中
教授28人，
副教授、助理教授18人；另有技术人员30人，研究助理47人，行政人员5人。所有固定研究人员均具有海外留学或访问经历，98%具有博士学位。实验室拥有
中国科学院院士1人，“闽江学者”特聘教授3人，厦门大学特聘教授1人，国家杰出青年基金获得者5人。此外，实验室的一批年轻骨干队伍正在健康成长，已有教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者9人，福建省杰出青年基金获得者2人。
实验室瞄准与全球变化有关的重大科学问题，直面国家对海洋环境保护和生态安全的重大需求，以多学科交叉为基础、以技术创新为动力、以台湾海峡及其毗邻海域为典型研究区域，主攻
海洋生物地球化学过程及其与
海洋生态系统相互作用，深入研究在自然变化和人类活动影响下的海洋生态系统对环境变化的响应和反馈，为我国海洋环境和生态保护提供科学基础和科技支撑，成为对外开放、具有国际影响力的海洋环境科学的基础性研究和人才培养与聚集的重要基地。
l张勇、朱亚先、王萍、陈丽、吴芳，“红树林湿地典型PAHs环境行为原位研究新方法”获2011年
中国分析测试协会科学技术奖二等奖