作为末世掌机WSC上的一款机战，C3的表现可以说是非常糟糕。然而，无论从剧情策划还是系统设计上，C3都是一部革命性的作品。从某些角度还说，还是值得玩家去细细品位的。
在地上展开的战斗，光子力研究所的兜甲児驾驶着爱机魔神Z与科学要塞研究所的剑铁也和他的大魔神共同的作战，使得对迈锡尼帝国的作战打上了终止符。与百鬼一族的战斗，由于早乙女研究所的盖塔机器人的频繁出动，大体上战斗已经接近尾声。南原研究所和坎贝尔星人现在也将要迎接最后的战斗。
同时，宇宙方面，以从吉翁残党和联邦的腐败产生出的
提坦斯为首，此外
哈曼统领的新吉翁军，以及从中派生出的格雷米军，还有对宇宙战争表示担心的特列斯和他率领的OZ。这些组织大体上都保持沉默，比较而言，规模较大的是提坦斯集结残部的情况。地球上看起来似乎开始陷入历史以来的最大危机的…
不过，问题在这里。减轻了状况的联邦组织是有着丰富战斗经验的阿加玛队特别游击部队，剩余的战斗由布莱德大佐和这个小队来排除。在地上作战中，阿加玛队与协力作战的超级机器人们的联系突然被中断了。由于这个原因的存在，之后半年…各组织余党的扫除进展缓慢。舆论批评联邦组织不能对造成兵力间持续相互摩擦情况的责任提出一个解决的办法…