1947年初，在开辟沙南新区的同时，豫皖苏第二、三地委分别派遣干部深入涡河以南、阜阳以北地区开辟新区，相继成立阜阳县委、涡亳县委。9月，陈粟大军挺进
豫皖苏，第三地委乘势成立涡南工委和淮上支队，活动在涡、蒙、颍、凤一带。10月，豫皖苏党委决定成立豫皖苏第六地委和第六军分区。10月22日，六分区在涡亳县正式成立。
1948年2月，华野3纵将师直机关转为分区机关。设司令部、政治部、供给处、卫生处。驻涡阳张村铺（今属利辛县）和高公庙一带。隶属豫皖苏军区，下辖11团（原三分区二支队）、12团（原二分区5团）和8个县大队，总兵力约2000余人，至1949年初达15000余人。
政委：张德群（化名何启光，1947年10月 - 1948年2月），
罗野岗（1948年2月 - 1949年2月）