西安交通大学医学部基础医学院（School of Basic Medicine, Xi 'an Jiaotong University Health Science Center）是西安交通大学医学部下设的二级学院。

1937年，基础医学院的学科形成。

1979年，获国务院学位委员会首批硕士学位授予权。

1981年，获国务院学位委员会首批博士学位授予权。

1986年，成立西安医科大学基础医学院。

2000年4月，西安医科大学与西安交通大学、陕西财经学院三校合并成立西安交通大学医学院，基础医学院取消建制；同年，获得基础医学一级学科博士学位授权点和博士后流动站。

2007年，获生物学一级学科博士学位授权点。

2010年，获生物学一级学科博士后流动站。

2014年底，基础医学院恢复建制。

据2023年5月学院官网数据，学院下设10个教学系，开设1个本科专业。

教学系：生理学与病理生理学系、人体解剖与组织胚胎学系、病理学系、药理学系、病原生物学与免疫学系、生物化学与分子生物学系、细胞生物学与遗传学系、神经生物学系、生物物理学系、医学实验动物学系

本科专业：基础医学

据2023年5月学院官网数据，学院有教职员工247人，教育部新世纪人才4人；享受国家政府津贴专家6名，陕西省教学名师2人；教授41人，副教授81人，博士生导师48人、硕士生导师117人，讲师61人；专职科研博士后8人；教辅、科研辅助人员53人；有国家级和省级优秀教学团队4个。

国家级优秀教学团队：生理学、药理学

享受国家政府津贴专家：闫剑群、臧伟进等

教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者：孙宏志等

卫生部有突出贡献中青年专家：臧伟进

陕西省优秀教学团队：生物化学与分子生物学、微生物学与免疫学

陕西省教学名师：闫剑群、臧伟进

陕西省有突出贡献专家：臧伟进

陕西省优秀留学归国人员：臧伟进

陕西省“特支计划”教学名师：臧伟进

据2023年5月学院官网数据，学院有博士后科研流动站3个，一级学科博士学位授权点2个，二级学科博士学位授权点1个，一级学科硕士学位授权点2个，二级学科硕士学位授权点1个；有国家二级重点学科1个。

博士后科研流动站：基础医学、生物学、药学

一级学科博士学位授权点：基础医学、生物学

二级学科博士学位授权点：药理学

一级学科硕士学位授权点：基础医学、生物学

二级学科硕士学位授权点：药理学

国家二级重点学科：生理学

据2023年5月学院官网数据，学院国家级一流本科专业1个；国家级精品课程1门，国家双语示范课程1门，国家级精品资源公开课1门，省级精品课程12门；省级实验教学中心1个，校级实验教学平台1个。

国家级一流本科专业：基础医学

国家级精品课程：生理学

国家双语示范课程：药理学

国家级精品资源公开课：生理学

省级实验教学中心：基础医学实验教学示范中心

校级实验教学平台：西安交通大学机能实验教学平台

据2023年5月学院官网数据，学院2005年获得国家级教学成果二等奖1项，2013年获陕西省教学成果二等奖1项；作为主编或副主编编写基础课程国家级规划教材20部。

国家级规划教材：生理学、局部解剖学、药理学、机能实验学、临床医学专业“器官-系统”整合课程与PBL教学系列教材等

据2023年5月学院官网数据，学院有教育部重点实验室1个，省级科研支撑平台2个，院级系所中心科研平台11个，转化医学研究院下设院级研究所6个。

教育部重点实验室：环境与疾病相关基因教育部重点实验室

省级科研支撑平台：陕西省医学实验动物中心、新型治疗性疫苗工程技术研究中心

院级系所中心科研平台：生理学与病理生理学系实验平台、人体解剖学与组织胚胎学系实验平台、病原生物学与免疫学系实验平台、病理学系实验平台、细胞生物学与遗传学系实验平台、生物化学与分子生物学系实验平台、药理学系实验平台、心血管研究中心实验平台、癌症研究所实验平台、生物医学工程研究所实验平台、神经生物学研究所实验平台

院级研究所：分子转化医学研究所、心血管研究所、感染与免疫研究所、医学工程研究所、脑科学研究所和遗传与发育研究所

据2023年5月学院官网数据，学院近五年承担重大项目（973、863及科技支撑计划）4项，国家自然科学基金项目118项，发表SCI期刊源论文595篇；授权国家发明专利27项，实用新型专利4项；获陕西省科学技术奖一等奖、二等奖等4项。

据2023年5月学院官网数据，学院同美国、英国、澳大利亚、瑞典、日本等十多个国家和地区的医学院校和卫生机构建立了合作关系，例如世界卫生组织、美国中华医学基金会、哈佛大学、埃默里大学、内布拉斯加大学、加州大学洛杉矶分校、利物浦大学等，合作的主要内容包括联合培养学生、教师医师研修、合作研究、举办学术会议等。

学院曾开展“疫情下的研究生——压力调适与应对”心理健康讲座、线上安全教育专题讲座、“中华之声”合唱比赛、“友谊杯”拔河比赛等文化活动。