藻菌纲（Phycomycetes）是真菌门的一纲。本纲约有200多属，1500多种。有水生、陆生或两栖。

生物学特征：都是分枝的丝状体，常无横隔壁而多核。无性生殖产生游动孢子或孢囊孢子。有性生殖有同配、异配或卵式生殖或接合生殖。

常见种类：

黑根霉(Rhizopus nigricans)：也称面包霉，多腐生于含淀粉食品上，菌丝体由分枝、不具横隔壁的菌丝组成，含有许多细胞核。菌丝横生，向下有假根，向上可生出孢子囊梗，先端分隔形成孢子囊，生有许多黑色孢子，孢子可萌发成新植株。也进行有性生殖，这种真菌，常使蔬菜、水果、食物等腐烂。

白锈菌(Albugo candida)：可引起十字花科植物的白锈病。

葡萄单轴霉(Plasmopara viticola)：会引起葡萄霜霉病。

水霉属(Saprolegnia)：是鱼类养殖业上的常见病原菌。感染此病的鱼类，体表上会生有白色棉毛状菌丝。以致游动慢，食欲减，终至死亡。