藻琴站（藻琴駅）是一由北海道旅客铁道（JR北海道）所经营的铁路车站，位于日本北海道网走市境内，是钏网本线沿线的一个无人车站。藻琴站隶属JR北海道钏路支社管辖范围，由知床斜里车站管理。藻琴站的站名源自爱奴语中的“モコト”或“ポ・コッ・ト”，意指“有小孩（副沼）的沼泽”。虽然在1992年废除简易委托化之后，就成为无人车站，但藻琴站内设有一家咖啡店“轻食与咖啡 小火车”（軽食&喫茶 トロッコ）。与许多北海道道北或道东地区的车站同样，藻琴站在过去也曾是轻便轨道铁路线与日本国铁路线的衔接车站。1935年时殖民轨道东藻琴线通车，连结藻琴站与位于旧东藻琴村（今大空町一部份）的东藻琴站。之后殖民轨道东藻琴线更名为东藻琴村营轨道（今网走交通巴士前身），并于1961年时废线，改以一般公路客运代替，藻琴站也不再具有铁路转运车站的地位。
在
2007年至
2008年期间，曾经在藻琴及滨小清水之间进行双模式车辆的试营运，但2009年之后就已停办。
1924年（
大正13年）
11月15日 - 以国有铁道车站的身份开始营业，属一般车站等级。