菏泽市人民检察院是山东省菏泽市境内的司法机关，办公地址位于菏泽市牡丹区中华路1116号。

设办公室、人事处、组织教育处、新闻宣传办公室、第一检察部、第二检察部、第三检察部、第四检察部、第五检察部、第六检察部、第七检察部、第八检察部、法律政策研究室、案件管理办公室、检务督察部(挂巡察工作领导小组办公室牌子)、检察业务保障部(挂法警支队牌子)、检察事务保障部等17个内设机构，机关党委、离退休干部处按照有关规定设置。

该院连续三年被市委市政府表彰为“平安菏泽建设先进单位”，连续四年被市委表彰为“思想政治工作先进单位”，先后被为“全市公正执法模范单位”、“市级文明单位”、“全省践行社会主义法治理念先进单位”、“省级卫生先进单位”。市院政治部、行装处先后被省院记集体二等功，市院离退休干部党支部继被省委组织部、省委老干部局表彰为“全省先进离退休干部党支部”、“全省离退休干部工作先进集体”。

2021年1月28日，入选中共山东省委组织部公示的“勇于创新奖”先进集体拟表彰名单。

2021年6月28日，菏泽市人民检察院机关党委被中共中央授予“全国先进基层党组织”称号。

党组书记、检察长：李宏宇

副检察长：时维建、孙硕