菏泽市人民政府是中华人民共和国山东省菏泽市的国家行政管理机关。

1938年夏至1945年8月，中国共产党在境内建立了冀鲁豫第八、第十、第十一3个专区。解放战争时期，第八专区改为第二专区，第十专区改为第五专区，第十一专区改为第三专区，新建了冀鲁豫第七专区。

1948年9月，菏泽全境解放。

1949年3月，中国共产党在菏泽建立的冀鲁豫第二、三、五、七专区分别更名为临河、湖西、鲁西南、运西专区。同年8月，平原省建立，将临河、鲁西南、运西专区的部分县合并为菏泽专区，与湖西专区同属平原省。

1952年11月，平原省撤销，菏泽、湖西专区归属山东省。原菏泽专区所辖的东明县划归河南省郑州专区。

1953年8月20日，湖西专区撤销，单县、复程、成武、巨野划归菏泽专区，嘉祥、金乡、鱼台划归济宁专区，同时撤销南旺县，析入梁山和嘉祥县。

至1953年底，菏泽专区共辖10县：菏泽、鄄城、郓城、梁山、巨野、成武、定陶、曹县、单县、复程，菏泽市的区域基本形成。

1956年3月6日撤销复程县，析入曹县和单县。

1958年12月，撤销定陶县，析入成武和菏泽县；同时撤销菏泽专区，其所辖菏泽、鄄城、郓城、梁山、巨野、成武、曹县、单县等8县划归济宁专区。

1959年9月，菏泽专区恢复，仍领原8县。

1960年10月，改菏泽县为菏泽市，同时将济南市的平阴县划归菏泽专区。

1961年3月，平阴县划归泰安专区。10月，恢复定陶县。

1963年3月16日，改菏泽市为菏泽县。4月，东明县由河南省开封专区划归菏泽专区。同年底，菏泽专区共辖10县：菏泽、曹县、定陶、成武、单县、巨野、梁山、郓城、鄄城、东明。

1967年3月改菏泽专区为菏泽地区。

1983年9月，菏泽县再次改为菏泽市(县级)。

1989年12月22日，梁山县划归济宁市。

2000年6月10日，经国务院批准，改菏泽地区为菏泽市(地级)，原菏泽市(县级)更名为牡丹区。

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参考资料

2018年末，菏泽市辖牡丹区、定陶区、曹县、成武、单县、巨野、郓城、鄄城、东明 2区 7县（2016年4月 29日，定陶县正式撤县设立定陶区）1个省级经济技术开发区，1个高新技术开发区，168个乡、镇、街道办事处（乡 10个，镇 126个，32个街道办事处），6019个村（社区）。

2021年6月，菏泽市人民政府办公室被授予“山东省脱贫攻坚先进集体”称号。

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