菌丝体(mycelium)，是菌丝的集合体，纵横交错，形态各异，具有多样性。菌丝细胞的分裂多在每条菌丝的顶端进行，前端分枝。菌丝在基质中或培养基上蔓延伸展，反复分枝网状成菌丝群，通称菌丝体。其功能至少有吸收营养、代谢物质的运输、代谢产物的储藏及繁殖等四种。按照发育顺序，菌丝体可分为初生菌丝体、次生菌丝体和三次菌丝体。

菌丝体由许多分支丝状的菌丝组成，而菌丝则由孢子萌发繁殖而成，是个管状细胞组成的丝状物，呈绒毛状，具有横膈的分枝，壁薄，透明，直径2～3μm。由孢子萌发出的初期菌丝，每个细胞中只有1个细胞核，故称为单核菌丝，也叫初生菌丝，其菌丝较纤细，分枝角度小，生长缓慢，生活力较差，属单性不孕，不会结子实体。单核菌丝生长到一定的阶段，两个单核菌丝互相接触，细胞彼此沟通，原生质融合在一起，产生锁状联合，形成双核菌丝体。

按照发育顺序，菌丝体可分为初生菌丝体、次生菌丝体和三次菌丝体。

（1）初生菌丝体

它是由单核孢子萌发所形成的菌丝体，并有桶状隔膜，多为单核、单倍体，故又称单核菌丝体或一次菌丝体。由初生菌丝体上可产生厚垣孢子、芽孢子、分生孢子、节孢子、粉孢子等无性孢子。它们也是单核单倍体。初生菌体发育时间很短，以后发育方向主要是次生菌丝体。在担子菌中，多数初生菌丝体不能形成子实体。但是，滑菇及蜡伞属的几个种除外。

少数担子菌，如双孢蘑菇的孢子萌发时，则含有两核。另外，有些蕈菌的孢子萌发时，也不是一开始就成菌丝状。如银耳，它先以芽殖方式产生大量芽孢子，再由芽孢子萌发为单核菌丝。又如木耳的担孢子有时也并不直接萌发为菌丝，而是先在担孢子中产生横隔，隔成多个细胞，每个细胞又产生多个钩状分生孢子，再由钩状分生孢子萌发成菌丝。这些孢子都是无性孢子，又为次生孢子。粉孢子通过菌丝顶端直接断裂形成薄壁的繁殖体，每段可长成新的个体。分生孢子通常着生在于分生孢子梗上。由单核菌丝，或双核菌丝顶端，或旁侧分别形成的薄壁细胞，萌发后又变成单核菌丝或双核菌丝。金针菇、滑菇、黑木耳在生活史中均能产生单核分生孢子；厚垣孢子由菌丝细胞壁增厚而变成。它呈圆球形，问生，成熟后脱离或不脱离菌丝。由于厚垣孢子细胞内富含水及营养物质，能抵御不良环境。条件适宜时，它能萌发形成菌丝体。厚垣孢子在草菇、蘑菇、鬼伞中较常见。节孢子又称节状分生孢子。它是由菌丝细胞分隔后断裂而成的单个细胞，一般长椭圆形，两端浑圆，节孢子常见于银耳目菌类生活史中，它是银耳重要特征之一。银耳的单核菌丝，双核菌丝均能以断裂方式或形成节孢子方式，其节孢子通常以出芽方式增殖，形成类似酵母状芽孢菌落。

（2）次生菌丝体

它由两条可亲和的初生菌丝细胞经原生质融合（质配）发育而成，故而有两个核。担子菌的初生菌丝配对在早期进行。在形成次生菌丝体时，两个初生菌丝的细胞核并不融合，因此，双核菌丝细胞是担子菌类的主要菌丝细胞形态。次生菌丝体的每个细胞含有两个核，故而又称双核菌丝体，遗传学上可用n+n表示，以区别于单核细胞(n)和合子(2n)。一个细胞中的两个核，在遗传上可以是来源于同核，也可以源于异核，前者形成同核双核菌丝体，后者则形成异核双核菌丝体，又称异核体。

（3）三次菌丝体

双核菌丝进一步分化发育，就在其上发育成子实体。这种已组织化了的双核菌丝体称为三次菌丝体或结实性双核菌丝。

食用菌是异养生物，没有根、茎、叶的分化，菌丝细胞不含光合色素，不能进行光合作用。食用菌是通过菌丝表面的渗透作用，从周围基质中吸收可溶性养料的，多数营腐生、共生生活，少数以寄生方式生活。用于生产栽培的菇类食用菌，几乎都是腐生生活的。在自然界中，菌丝体是多年生的，常生活于富含有机质的枯立木、倒木、落叶层、粪草等环境里，如果条件适宜，菌丝体可以无休止地繁殖下去。菌丝体的繁殖通常是从一点开始向周围呈辐射状蔓延扩展的，因此，有些菇类外围新生菌丝形成的子实体常呈圈状分布，称“蘑菇圈”或“仙人环”。草原上的口蘑、雷蘑，松林里的松口蘑、蛤蟆菌，都是形成蘑菇圈的著名食用菌或毒菇。了解这些特性对野外采集有一定的指导意义。

食用菌菌丝的生命力随时间的加长而逐渐降低。幼嫩菌丝细胞的原生质稠厚，液泡细小而分散，生命力较强；老生菌丝细胞的原生质中出现气泡，生命力衰退。因此，菌种分离和菌种移植都要选用生命力较强的幼嫩菌丝为材料。

在自然界中，菌丝体是多年生的，常生活于富含有机质的枯立木、倒木、落叶层、粪草等环境里。

如果条件适宜，菌丝体可以无休止地繁殖下去。菌丝体的繁殖通常是从一点开始向周围呈辐射状蔓延扩展的，因此，有些菇类外围新生菌丝形成的子实体常呈圈状分布，称“蘑菇圈”或“仙人环”。草原上的口蘑、雷蘑，松林里的松口蘑、蛤蟆菌，都是形成蘑菇圈的著名食用菌或毒菇。

其功能至少有吸收营养、代谢物质的运输、代谢产物的储藏及繁殖等四种。

供食用。菌丝体是食用菌的营养器官。

菌丝体是真菌营养体的基本结构，一般处于分散状态，但是，有些真菌的菌丝体在生长的一定阶段或遇到不良条件时，部分分散的菌丝体可以相互扭结形成菌核、子座、菌索等特殊的菌丝体。

（一）菌核

菌核是由菌丝密集而成的块状或颗粒状的休眠体，质地坚硬、色深、大小不一，小的如鼠粪，大的如头颅，一般呈深褐色。菌核外层细胞较小，细胞壁厚；内部细胞较大，壁薄，大多为白色粉状肉质。菌核是真菌的储藏器官，又是渡过不良环境的菌丝组织。我国常见的真菌药材—茯苓、猪苓、雷丸都是这些真菌的菌核。菌核有很强的再生能力。在条件适宜时，菌核可以萌发产生菌丝，或由菌核上直接产生子实体，释放孢子，繁衍后代，因此，可以作为菌种分离的材料或做菌种使用。

（二）子座

子座是真菌从营养阶段发育到繁殖阶段的一种过渡形式，某些子囊菌有子座。子座可以由纯菌丝体组成，也可以由菌丝体和部分营养基质相结合而形成。子座形态不一，食用菌的子座多为棒状，如名贵中药冬虫夏草、蝉花、蛹草等的子座均呈棒状，子囊孢子生于棒状子座的顶端。

（三）菌索

菌索是由菌丝组成的绳索状结构，与树根相似，故又称根状菌索。菌索与菌核很相似，皮层菌丝排列紧密，角质化，条件恶劣时能够抵抗不良环境；内部菌丝成柬排列，具有输导作用；前端有似根的生长点，遇到适宜的条件又可以恢复生长，生长点可形成子实体。有的担子菌与高等植物共生，形成菌根，如牛肝菌、红菇、口蘑和蜜环菌等，药用天麻（兰科植物）的发育就是依靠蜜环菌的根状菌素输送养分。蜜环菌、假蜜环菌的幼嫩菌索可以发出波长为530nm的蓝绿色荧光，其生活力与发光强弱呈正比，因此，常取发光强的部分做分离材料。