莱布尼茨海洋科学研究所是位于德国基尔境内的科研机构，成立时间为2004年。

莱布尼茨海洋科学研究所（德语：Leibniz-Institut für Meereswissenschaften）是一个位于德国基尔的海洋研究所，由州及联邦政府联合成立于2004年。莱布尼茨海洋科学研究所是莱布尼茨学会的成员，也是世界鱼类数据库联合会参与各方的协调者。该研究所参与全球所有大洋的海洋研究，在气候动力学、海洋生态学和生物地球化学、洋底动力与循环等领域成就突出。莱布尼茨海洋科学研究所和基尔大学合作颁发学位，并运营基尔水族馆和智库“Lithothek”。