元初改为单檐歇山式石构建筑，面阔3间，宽6.7米，进深2间，长3.4米，檐下用单挑华拱。石室背后巨岩耸峙，林阴遮掩。庵前有山涧流水，古桧数株，更添几分清净雅致。原来庵前还有一座佛教寺，已废，后又重建，焕然一新，花木、果树相映，风景十分优美清净，为一番别致景色。数十米处有
摩尼教咒语崖刻一方，“劝念：清净光明，大力智慧，无上至真，摩尼光佛。正统乙丑年九月。”
正厅内依崖凿一圆形佛盒，直径1.9米，圈内浮雕一尊摩尼光佛坐像，佛身高1.52米，宽0.83米，头部比较特别，呈现辉绿岩（青斗石）颜色，长方形面孔0.32X0． 25米，背有毫光射纹饰，呈现花岗岩石质，散发披肩，端坐莲坛，面容圆润，眉毛隆起，颚下二条长须，嘴唇薄，嘴角线深显，形成下额圆突，显得安详自如；身穿宽袖僧衣，胸襟打结带，无扣，结带用圆饰套束蝴蝶形，而向两侧下垂于脚部，双手相叠平放，手心向上置于膝上，神态庄严慈善，衣褶简朴流畅，用对称的纹饰表现时代风格，脸、身、手三部分巧妙地利用岩石不同的自然色调构设，风格迥异，背雕毫光四射纹饰，世称“摩尼光佛”。这是世界仅存的一尊
摩尼教石雕佛像，列为全国重点文物保护单位。
在佛龛的左上角阴刻一段文字“谢店市信士陈真泽立寺，喜舍本师圣像，祈荐考（女比）早生佛地者。至元五年戌月日记”。五行楷书，34字，字径2. 5X2．5厘米。在右上角还有阴刻比较粗糙的文字“兴化路罗山境姚兴祖，奉舍石室一完。祈荐先君正卿姚汝坚三十三宴，（女比）郭氏五九太孺，继母黄十三娘，先兄姚月涧，四学世生界者。”这些文字价值性很高，是世界唯一摩尼光佛造像和庵寺建筑年代可借的文字佐证，非常可贵，同时也是研究
泉州明教的一手历史材料。
泉州的
摩尼教活动于
元代是比较公开性的，说明泉州的明教是以佛为崇拜而盛行的。据传有
泉州十八位读书士子住于
草庵勤奋读书，常于此显现佛的形象，说是文殊菩萨的显影，因此在摩尼光佛坐像两侧有弘一法师手书木刻对联“石壁光明相传为文佛显影”，“史乘记载于此有名贤读书”。
草庵摩尼教寺引起了世界学术界、宗教界的巨大兴趣。1987年8月，在
瑞典隆德大学召开首届国际摩尼教学术讨论会，草庵摩尼佛造像作为讨论会的纪念性吉祥物。1991年2月，
联合国教科文组织“
海上丝绸之路”综合考察团参观后，认为是这次考察活动的“最大发现”。