苏州市善耕实验小学校创办于光绪三十三年（1906年），初名长洲县官立高等小学堂，1951年始名苏州市善耕中心小学校，2008年7月更名为苏州市善耕实验小学校，并于2009年8月迁址至
平江新城新校区。在学校百年校史中出现了中国工程院院士2名，中国科学院院士2名。
学校创办于光绪三十三年（1906年），初名长洲县官立高等小学堂，1951年始名苏州市善耕中心小学校，2008年7月更名为苏州市善耕实验小学校，并于2009年8月迁址至平江新城新校区。
学校百年历程人材辈出，先后涌现了中国第一代交响乐指挥家
黄贻钧；中国科学院院士，中国原子能科学研究院学术顾问委员会委员兼中国科学院北京正负电子对撞机国家实验室副主任，获国家自然科学奖的原子能专家
丁大钊；中国科学院院士，国家教委科技委员，国际结构和多学科优化协会执行理事，获国家科技进步奖的工程力学专家
程耿东；中国工程院院士，现任中国计量科学研究院实验室主任、研究员，《计量学报》编委会主任，获得何利何梁奖的中国计量学专家
张钟华博士，他们践行了“今日我以善耕为荣，明日善耕以我为荣”的教育理念。
由于学校的发展，2008年平江区政府、区教育和体育局进行了教育资源的区域优化，在平江新城建造了学校新校区。2009年7月原善耕实小合并北校区和书院，整体搬迁至平江新城新校区，开始新的办学征程。
善耕实小新校区由市、区政府投资1.2亿、占地2.7万平方米，建筑面积1.6万平方米，拥有多媒体教室47间，各专用教室22间，教学辅助用室15间及4113平方米的体育馆、250米环形塑胶6跑道运动场，硬件设施先进，是一所装备现代化的小学。
第四任校长韩秉直先生命名学校为“善耕”，以善于耕耘比喻善教善导，精心育才，以此要求教师循循善诱，教书育人，要求学生能成为身体健康，品德高尚，学有专长，奋发向上的人。
苏州市善耕实验小学校被命名为全国中小学机器人实验学校、江苏省青少年机器人实验基地、江苏省青少年科技教育先进学校、苏州市教育信息化先进学校、苏州市双语实验学校等荣誉称号。使这所具有光荣历史的百年老校，勃发出青春活力。