人类认识世界的两种互相
区别、互相联系的形式。哲学作为世界观和方法论，又总是不断地从自然科学中吸取营养，随着科学的发展而发展，并反过来给科学以积极的或消极的影响。
自然科学与哲学是历史地相互联系的。在古希腊，人们主要以直观的思辨形式从总体上认识自然界。随着实践经验的积累，自然科学逐渐从哲学中分化出来，成为建立在观察和实验的基础上、经过严密逻辑论证的认识形式。从此,哲学与自然科学成为两类独立的学科,哲学为自然科学提供思维形式，自然科学为哲学准备经验基础和某些思想材料。近代自然科学的始祖F.培根，就以其唯物主义的经验论为整整一个历史时代指明了科学发展的道路,而牛顿力学（见I.牛顿）的建立又推动了这种唯物主义哲学的发展。18世纪末，自然科学的新变革，也促进了德国古典哲学这种双向交流的作用。19世纪自然科学的一系列重大发现，在哲学领域中引起了根本性的变革,产生了
辩证唯物主义。20世纪,现代科学向自然界更深层次的进军以及它的整体化趋势，迫使科学更加自觉地求助于哲学思维，同时也推动
马克思主义哲学在辩证唯物主义的基础上进一步改变自己的形式，达到科学与哲学在更高阶段上的联系。
在人类认识史上，自然科学与哲学之间的联系也会在某些特定历史条件下遭到歪曲。一方面，哲学会脱离自然科学的发展，妄想借助于纯粹思辨而获得对自然界的终极认识，赋予自己以高踞于科学之上指挥科学、强行把科学纳入自己的体系的特权，结果不仅造成自己的僵化，而且也阻碍了科学的发展。例如，中世纪的经院哲学和19世纪的
德国自然哲学就在不同程度上有过这种情况。另一方面，一些科学家在某种错误的哲学思潮影响下，也会产生蔑视甚至厌恶哲学的倾向，完全否定先进哲学对科学的积极作用，并力图消除科学中的一切哲学因素，结果使他们的科学研究局限于狭隘的
经验材料之中，失去创造性，给科学的发展带来不利影响。例如，19世纪后半期以来在科学中流传的实证主义，在一定程度上对一些科学家起过这样的消极作用。
马克思主义哲学既反对用哲学代替科学的“自然哲学”倾向，也反对用科学取消哲学的实证主义倾向，认为哲学与自然科学是既相互区别又相互联系的整个认识系统中的两大分支。