自然授粉又分为风媒、虫媒、水媒、鸟媒等。园艺作物育种中的
染色体工程还包括单倍体、非整倍体和额外染色体（即B一染色体）等内容，但因这些方面在花卉育种中成功的例子不多。
自然传粉的方式有下列几种：①借助于风力；②少数植物的花粉是靠水传播的；③大多数植物种类是靠动物，尤其是昆虫传粉。前两种的传粉方式，都是靠大自然的动力。而第三种靠花的颜色、香味和花蜜来引诱昆虫，其中有些纯属哄骗，如
梅花草属（Parnassi8spp）是以有光泽的花蜜样的突起，而Ophrysspp则以昆虫样的花来诱骗的。但大多数植物是靠花为昆虫提供了花蜜和蛋白质。除昆虫之外，芦荟属、Antholyza、倒挂金种属、木槿属、Kniphophia和鹤望兰属则是靠鸟类传粉的。而许多菊科植物的花粉，如Chrysanthemumleucanthemum，却是由蛞蝓传播的。
我国的大多数栽培作物的主要传粉者是蜜蜂和野蜂。但是，还有一些昆虫在某些作物的传粉上，也起着很大的作用。尤其是苍蝇，它们对伞形花科植物如胡萝卜和欧洲防风属是主要传粉者。蝴蝶则倾向于为与它们自身的颜色相似的花传粉。而烟草和蝴蝶兰PatantheraChlorantha，则以它们弥散的香味、白色的花和长的花蜜管，来适应于黑蝇蛾为它们传粉。特别有趣的是丝兰属植物，它是靠蛾Pron以aYuccasella的幼虫传粉的。它们的成虫将收集的花粉粘成一个球，而后将球转移到另一朵花的柱头上，待花粉萌发进入子房时，也将蛾的一些卵带进去，因此，其幼虫便在受精后发育的子房内靠其营养物质饲喂成长，从而毁坏了大约20%的种子，但其它的子房则发育正常。
黄蜂是雪果属（Symphoricarpusspp）和玄参属（Scrophulariaspp）的主要传粉者。姬蜂的授粉对象则是羊尔兰属（Listeraovata）。野生无花果有三种关闭状液囊样的开花或“结实”类型，即已经知道的雄、雌和特殊的不育类型，它们都能作为单独的无花果受精个体，由自然界的黄蜂幼虫传粉。雌黄峰蝇成虫为所有的三种无花果类型传粉，其中只有可育的类型不适于抚养它的幼虫。大多数栽培的无花果都不是虫媒类型，因为它们的可供食用的新鲜果实是无种子的，没有必要通过受精产生。但在种植园中的伊兹密尔无花果的果实，却需要由黄蜂进行有效的传粉及发育长成，因为它们需要用于脱水加工。
有些属于闭花受精的类型，其中包括酢浆草、宝盖草，有时也开花，但却在花蕾期完成受精。也有许多植物开出的花尽管都适于昆虫传粉，但却是自花受精的，其中包括菊科、豆科的许多成员，诸如莴苣属、菊苣属、法国菜豆和豌豆属。