自然异交率（%）=F1中显性性状个体数/F1总个体数×100×2。

（1）选择受一对基因控制的相对性状作为遗传测定的标记性状。如棉花的绿苗对芽黄苗；（2）用具有隐性性状的品种作母本，具有显性相对性状的纯合基因型品种作为父本；（3）将父本和母本等距、等量的隔行相间种植，任其自由的传粉、结实；（4）将母本种子后代进行性状测定，计算显性性状的个体比例，就是天然异交率；